В настоящее время Исааку Собаке атрибутируется (полностью или частично) написание более чем 20 книг. Среди них наиболее известны исследователям каллиграфические, с богатой орнаментикой Евангелие учительное, переписанное в 1524 г. для Троице-Сергиева монастыря (Российская государственная библиотека), Евангелие-тетр 1530/1531 г. (Российская государственная библиотека), Апостол 1530–1540 гг. (Российская государственная библиотека) и Евангелие-тетр, написанное для митрополита Иоасафа примерно в то же время, по мнению исследователей, вскоре после освобождения (Покровский собор, филиал Исторического музея). Книгописная деятельность Исаака Собаки изучена недостаточно. Исследователи утверждают, что атрибутированными рукописями книгописное наследие Исаака Собаки не ограничивается. Исследователи не сомневаются, что к его наследию относятся Евангелие-тетр (Научная библиотека Саратовского университета, первая треть XVI в.) и «Слова постнические» Исаака Сирина с миниатюрой (Государственный архив Ярославской области, первая треть XVI в.). Исаак Собака переписал начальную часть сборника житий и сказаний Библиотеки Академии Наук (вторая четверть XVI в.), принадлежавшего бывшему игумену Ферапонтова Белозерского в честь Рождества Пресвятой Богородицы монастыря Кассиану (Булгакову), который дал рукопись вкладом в эту обитель. Исследователи считают весьма вероятным, что Исаак Собака является первым писцом Кормчей русской редакции с копиями глосс Вассиана (Патрикеева). По мнению исследователей, в дальнейшем атрибуции рукописей Исаака Собаки возможны в составе как исторически сложившихся собраний, так и старообрядческих и частных коллекций XIX–XX вв. Большинство рукописей библейского содержания, переписанных Исааком Собакой, а также Евангелие учительное 1524 г. и список «Слов постнических» Исаака Сирина содержат исполненные на высоком уровне ранние образцы орнаментики старопечатного стиля, в первую очередь, заставки на основе гравированного «Большого алфавита» Исраэля ван Мекенема. В связи с этим исследователи высказали предположения о причастности Исаака Собаки к созданию и распространению этого стиля в русской рукописной книге. Впрочем, с той же долей вероятности исследователи утверждают, что Исаак Собака, работая в крупных книгописных центрах, сотрудничал с профессиональными иллюминаторами, непосредственно причастными к выработке русского варианта старопечатного стиля книжной орнаментики.