Книга 16 даёт краткую информацию о семи Вселенских (oecumenicis) соборах, признаваемых православной и католической церквами; всеобщих (generalibus), т.е. Соборах, получивших рецепцию только католической церкви, и Соборах католической церкви; далее о поместных Соборах. Всеобщие Соборы представлены от четвёртого Константинопольского 869–870 гг. до Тридентского 1545 г.: Латеранские (первый – пятый), Лионские (первый, второй), Вьеннский, Флорентийский; сообщается дата Собора, при каком папе и императоре он проходил и какие вопросы рассматривал. Так, о Флорентийском соборе говорится, что он состоялся при папе Евгении IV и византийском императоре Иоанне VIII Палеологе в 1439 г.; Собором была подписана уния (unio) между католической и православной церквами; также принят ряд постановлений: 1) слово «Filioque» законно вставлено в Символ веры; 2) в Тело Христово может прелагаться как пресный, так и квасной хлеб; 3) учение о существовании чистилища истинно; 4) папа Римский есть истинный наместник Христа и глава всей церкви. Информации о Соборах предшествует рассмотрение вопросов: что именуется Собором, какие бывают Соборы. О поместных Соборах древней церкви речь идёт в третьей главе. Согласно Иринею, Греко-Российская церковь признаёт десять из них: Антиохийский 270 г. (по другим источникам – 266 г.; «Правила православной Церкви» не включают этот Собор в число десяти), Анкирский 314 г. (по другим источникам – 308 г.), Неокесарийский 314 г. (по другим источникам – 311 г.; в «Правилах православной Церкви» – между 314 и 325 гг.), Гангрский 324 г. (в «Правилах православной Церкви» – 340 г.), второй Антиохийский 341 г., Сардикийский 347 г. (в «Правилах православной Церкви» – 343 г.), Лаодикийский (в «Правилах православной Церкви» – 343 г.), Карфагенский 399 г. (Ириней указывает на 133 правила этого Собора, однако такое число правил, по Афинской синтагме, относится к Собору 419 г., который издал 12 правил, остальные из 133 принадлежат 14 Соборам Африканской церкви, созывавшимся с 348 по 418  гг.), правила Константинопольского собора, который был проведён в храме св. Апостолов, Ириней объединяет с правилами Константинопольского собора в Святой Софии 879 г. В четвёртой главе «О церковной дисциплине» Ириней даёт сокращённое изложение 85 Апостольских правил; 20 правил первого Вселенского собора; 8 правил второго Вселенского собора; 8 правил третьего Вселенского собора; 30 правил четвёртого Вселенского собора; 102 правила Трулльского собора; 22 правила седьмого Вселенского собора (число правил соответствует употребляемой до настоящего времени Книге правил, кроме правил второго Вселенского Собора, – их 7, но в Кормчей книге седьмое правило разделено на два).