В Кирилловом Белозерском монастыре в церкви Преображения царь Фёдор устроил придел во имя великомученицы Ирины, в который царица вложила икону и пелену с образом её святой. Икона 1595 г. из Ирининского придела Кириллова Белозерского монастыря принадлежит к числу редких в древнерусской иконописи единоличных изображений Ирины. Она представлена в зелёном платье с оплечьем и в охристом мафории, завязанном на груди, на плечах лежат выбившиеся из-под плата пряди волос; в поднятой правой руке Ирина держит крест, в левой – свиток с текстом Символа веры; ангелы надевают ей на главу венец, который воспринимается как мученический, а не как знак знатного происхождения; надпись: «Святая мученица Христова Ирина». Для этой иконы в мастерской царицы Ирины была шита пелена (Русский музей) с такой же иконографией, а также выполнено ещё несколько шитых образов Ирины. Иконография ряда изображений Ирины отличается от традиционной. Так, на шитой иконе «Великомученик Феодор Стратилат и великомученица Ирина» из походного иконостаса (1592 г., Русский музей) Ирина изображена без короны, с непокрытыми волосами; отсутствие венца исследователи объясняют реставрационным вмешательством, при котором фигуры святых из-за ветхости были перенесены на новую основу. В Новодевичий монастырь царица Ирина Годунова вложила шитую пелену «Похвала Богоматери» (Исторический музей), выполненную после её пострига с именем царицы великомученицы Александры. Композиция «Похвала Богоматери» была дополнена ростовыми изображениями св. покровительниц царицы – Ирины и Александры. Изображение Ирины имеется также на пеленах «Богоматерь Казанская, со святыми Феодором Стратилатом и Ириной» (Русский музей) и «Богоматерь «Знамение», со святыми Феодором Стратилатом и Ириной» (Исторический музей). Царице Ирине Годуновой принадлежала небольшая иконка-реликварий «Св. мученица Ирина. Богоматерь на престоле» (1589 г., музеи Московского Кремля). В конце XVI в. парные изображения св. Феодора и Ирины появляются также в иконописи: например, на иконе «великомученик Феодор Стратилат и великомученица Ирина» (собрание Михаила Юрьевича Абрамова) Ирина изображена в платье, мафории и без венца. На минейных иконах начиная с XVI в. Ирина изображается под 5 мая в царском облачении, с венцом на голове, как на вологодской минее второй половины XVI в. (Вологодский музей-заповедник) или на минее XVI в. из Музея икон в Рекклингхаузене (Германия). Эта традиция получила продолжение и в более позднее время, например, палехская икона из собрания Михаила Евгеньевич Де Буара (Елизаветина). Ирина изображена в рост, в красной далматике с золотым лором и золотым венцом на непокрытых кудрявых волосах, с крестом в руке, среди св. жён на иконе-двухряднице «Избранные святые» (конец XVI в.) из Входо-Иерусалимской церкви в Каргополе (Вологодский музей-заповедник). С XVII в. на иконах, где святые располагаются по чинам святости, Ирина изображается среди великомучениц, например, на трёхстворчатых складнях: на левой створке складня «Богоматерь Владимирская, с праздниками и святыми» (начало XVII в., Третьяковская галерея); на правой створке складня «Богоматерь Владимирская, с праздниками и святыми» (первая четверть XVII в., старообрядческий Покровский собор в Рогожской слободе); внизу на левой створке походного иконостаса (середина XVII в., старообрядческий Покровский собор в Рогожской слободе).