Во втором ряду иконостаса есть иконы, написанные в 1588 г. Резной амвон на западной стене собора украшен иконами в 1775 г. С конца XVII в. в монастыре Ираклидия существовала иконописная школа, основанная иеромонахом Иоанникием. Его учеником был иеромонах Филарет из села Псимолофу, который, в свою очередь, стал наставником диакона Нектария, а тот – архимандрита Леонтия и монаха Филарета Младшего. Среди других известных исследователям живописцев, работавших в обители, были Досифей и Филофей. Иконы, написанные в мастерской монастыря Ираклидия, известны по всему Кипру. По сведениям В.Г. Григоровича-Барского (1735 г.), монастырь Ираклидия подчинялся непосредственно архиепископу. «Монастырь убо оный есть именем знаменит и зданием леп, и расположением пространен, имать же и виногради, и сады, и овцы, и поля». При этом, по словам автора, ни один из кипрских монастырей не терпел столько притеснений от турок, как монастырь Ираклидия, который стоял «на распутии». В это время в монастыре Ираклидия подвизалось шесть или семь иноков. Монастырь Ираклидия имел владения в различных сёлах и четыре подворья – в Строволосе, в Цери, Айос-Иоанисе близ Малунды и Прастио в Месаории. Подворье в Строволосе было продано в конце XVIII – начале XIX вв., другие просуществовали намного дольше. В 1773 г. Кипрский архиепископ Хрисанф отремонтировал монастырь Ираклидия. Он подарил обители водяную мельницу в Китрее и серебряную церковную утварь. В 1774 г. на его средства был сооружён иконостас. Иконы местного ряда («Христос Праведный Судия», Божьей Матери «Одигитрия» и святителя Ираклидия) выполнены в 1797 г., образ Иоанна Предтечи написан в 1611 г. В синодиконе монастыря Ираклидия хранится икона священномученика Ираклидия и коленопреклонённого архиепископа Хрисанфа с благословляющим их сверху Христом и монастырём Ираклидия на заднем плане. После 1821 г. монастырь действовал как приходский храм. В 1962 г. монахини Харифея, Феофано и Евпраксия из монастыря Преображения Господня в районе Каймакли Никосии по благословению архиепископа Макария III начали возрождение монастыря Ираклидия. Архиепископ оказывал покровительство и помощь монашеской общине, игуменьей которой стала Харифея (ум. в 2000 г.). Был восстановлен полуразрушенный кафоликон, построены корпуса с кельями, мастерскими и гостиницей, близ монастыря Ираклидия воздвигнут храм во имя Иоанна Предтечи. Благоустроена территория обители, дорожки выложены мозаикой, изготовленной сёстрами. На средства, предоставленные Киккским монастырём, были построены и оборудованы золотошвейная мастерская и пекарня. В 1964 г., во время расширения западного корпуса, была обнаружена гробница эпохи поздней бронзы. Поскольку систематические раскопки здесь не проводились, исследователям неясно, было ли это захоронение одиночным или являлось частью некрополя. Древние гробницы были найдены неподалёку – в Политико и близ холма Ламбертис. В настоящее время в монастыре Ираклидия подвизается 37 монахинь, игуменья – Продрома. Они занимаются иконописанием, золотным шитьём, садоводством и огородничеством, изготовлением оливкового масла и традиционных кипрских сладостей, главным образом, из миндаля.