Перед рукоположением он получил в дар от императора полное православное архиерейское облачение. В 1830 г. Иосиф предпринял шестимесячную поездку по всем униатским епархиям с целью ревизии и ознакомления на местах с ходом преобразований. Он решил побеседовать с каждым священнослужителем викариатства, собственноручно составил полный список подчинённого ему духовенства с кратким досье, ведомость с названиями всех униатских храмов Литовской епархии. Результатом стал доклад от 30 сентября того же года, засвидетельствовавший успех реформ и сочувствие им со стороны белого униатского духовенства. Впоследствии Иосиф ежегодно встречался и беседовал с каждым клириком епархии, выслушивал их просьбы, давал рекомендации. К 1830 г. во многом благодаря деятельности Иосифа греко-католическая церковь в России была подготовлена к воссоединению с православной. Но необходима была многолетняя кропотливая работа по укоренению нового церковного порядка и утверждению в сознании униатов необходимости возвращения в православие. Этому процессу помешало Польское восстание 1830–1831 гг., затронувшее белорусские территории. В 1831–1833 гг. подготовка к разрыву унии практически остановилась, что было обусловлено, в частности, отвлечением от проекта внимания императора Николая I и связанной с этим пассивной позицией Д.Н. Блудова, особенно после назначения его в феврале 1832 г. министром внутренних дел (с оставлением в должности главноуправляющего делами иностранных исповеданий). Противники обращения униатов к православию попытались с помощью интриг остановить уже начатые реформы. Наиболее заметной была деятельность василианского провинциала архимандрита Иосафата Жарского, который, невзирая на подозрения в сочувствии польским «патриотам», сумел добиться покровительства члена Государственного совета Николая Николаевича Новосильцева и связанных с ним чиновников. В ноябре 1831 г. он вошёл в состав Греко-униатской коллегии, провёл в 1832 г. ревизию 37 монастырей и в феврале 1833 г. представил собственный план реформирования унии, возвращавший её к прежним тенденциям полонизации и латинизации. Деятельность архимандрита Иосафата Жарского осуществлялась при попустительстве Д.Н. Блудова, не реагировавшего на предупреждения и протесты Иосифа. 17 февраля 1832 г. Иосиф подал прошение об освобождении его от должности заседателя коллегии и о направлении в епархию. Прошение не было удовлетворено. 26 июля и 15 октября 1832 г. Иосиф подал на имя Д.Н. Блудова записки «О ходе Униатского дела» и «О разных мерах, которые следовало бы принять по Униатскому делу». В них предлагался новый, более решительный план разрыва союза с Римом через выведение униатов из ведомства МВД и подчинение уже преобразованных органов руководства униатской церкви и её учебных заведений Святейшему Синоду. Согласно замыслу, эта мера, а также целенаправленная работа униатского начальства, стремящегося к воссоединению с подчинённым духовенством, должны были в течение трёх – четырёх лет привести к незаметному и полному растворению унии в господствующем исповедании. Но ответа на данное предложение не последовало.