Об этом говорит и тот факт, что литовский магнат Богуслав Радзивилл для установления контактов с Б.М. Хмельницким и Иваном Евстафьевичем Выговским искал посредничества Иосифа. Настоятельница пинского униатского монастыря Евфросиния выражала недовольство в связи с тем, что Иосиф поминал за богослужением только Б.М. Хмельницкого и позволял униатским священникам служить в Пинске лишь при условии перехода в православие. Летом 1657 г., когда войска Богдана Хмельницкого заняли Пинский повет, Иосиф активно содействовал переходу в православие местных униатских священников. В 1659–1661 гг. у Иосифа с Б. Радзивиллом был судебный процесс по поводу незаконного присвоения средств, завещанных Марией, вдовой гетмана Я. Радзивилла, заблудовскому Успенскому и виленскому Свято-Духову монастырям (последним в то время управлял Иосиф, в 1659–1660 гг. имевший титул «архимандрит лещинский и старший виленского Свято-Духова монастыря»). В марте 1661 г. суд вынес благоприятное для Иосифа решение, которое впоследствии несколько раз пересматривалось. В октябре 1657 г. Иосиф приехал в Киев для участия в выборах нового митрополита, в Киеве он находился и позднее. 5 января 1658 г. Иосиф вместе с киево-печерским архимандритом Иннокентием (Гизелем) обратился с письмом к царю. Разоблачая «лесть» враждебных царю «ляхов» и «литвы», западнорусские клирики сообщали о неприязни к царю новогрудской шляхты, обращали внимание на то, что в Волковыске, Гродно и других городах униаты сохраняют за собой церкви и владения. Эти сообщения, как полагают исследователи, исходили от Иосифа. Ему принадлежала просьба к царю послать войска в Пинский повет, который «напрасно оставиша». Летом 1658 г. воеводе Вильно князю Михаилу Семёновичу Шаховскому была отправлена царская грамота о высылке из воеводства униатов. В феврале 1658 г. Иосиф вместе с архимандритом Иннокентием (Гизелем) сопровождал нового митрополита Дионисия (Балабана-Тукальского) в поездке в Переяслав, где митрополит привёл гетмана И.Е. Выговского к присяге на верность царю. Иосиф и Иннокентий (Гизель) вместе с митрополитом получили подарки от Алексея Михайловича. После конфликта между И.Е. Выговским и царём Иосиф вместе с митрополитом встал на сторону гетмана. В 1659 г. Иосиф сопровождал митрополита Дионисия в поездке в Варшаву на сейм, где предстояла ратификация Гадячского договора, по которому гетманство становилось частью Польско-Литовского государства. В одном из сообщений о поездке Иосиф назван «наречённым епископом Мстиславским». Большая делегация духовенства во главе с митрополитом должна была добиваться признания сеймом таких положений Гадячского договора, как ликвидация унии и возвращение православной церкви всего имущества, принадлежавшего ей до 1596 г. Перечень пожеланий, привезённых в Варшаву казацким посольством, включал предложение вернуть Лещинской архимандритии земли, отобранные иезуитами и польскими шляхтичами С. Юдицким и Г. Войно-Ясенецким. Однако добиться принятия соответствующих пунктов договора не удалось. Положение о ликвидации унии в текст, ратифицированный сеймом, не попало, для раздела имущества между православными и униатами была создана очередная комиссия.