В 1884 г. в нижнем храме был освящён ещё один престол – во имя преподобного Исаакия Далматского, память которого празднуется 30 мая. К началу XX в. в Староторжском монастыре были две почитаемые иконы Иакова: одна находилась на гробнице святого, а вторая – в медно-посеребрённой ризе с серебряным венчиком – в Никольском приделе Троицкого собора. В начале XX в. Иаков считался канонизированным святым. В «Верном месяцеслове всех русских святых» (М., 1903 г.), составленном по донесениям, присланным в Святейший Синод из епархий в 1901–1902 гг., память Иакова указана под 30 мая и 4 апреля. Староторжский монастырь был закрыт в 1925 г. По воспоминаниям старожилов, в начале 1930 гг. могила Иакова была вскрыта, мощи извлечены, их дальнейшая судьба исследователям неизвестна. Вскоре храм в честь иконы Божьей Матери «Живоносный Источник» был разрушен. В настоящее время в уцелевших зданиях обители размещается Галичское педагогическое училище. Канонизация Иакова подтверждена включением его имени в Собор Костромских святых, празднование которому установлено в 1981 г. В иконописных подлинниках под 4 апреля внешность Иакова уподобляется облику преподобного Зосимы Соловецкого: «...Надсед, брада Зосимы Соловецкого, схима на плечах» (конец XVIII в. – Библиотека Академии Наук); «аки Зосима, схима, ризы преподобническия» (1830 гг. – Институт русской литературы). В подлиннике XVIII в. представлено описание Иакова, «иже на посаде на Сторожье, Галическаго новаго чудотворца; положен у церкви Бориса и Глеба под алтарем на правой стране; образом и подобием по всему аки Зосима Соловецкий, и ризами; схима на плечах». Подобное описание Иакова с добавлением: «...На гробе его образ, а в церкви другий», – приводится в «Описи предметов старины Галичскаго Николаевскаго Староторжскаго женскаго монастыря» (Государственный архив Костромской области), составленной в 1904 г. настоятельницей монастыря игуменьей Ангелиной, которая указала, что при создании описи использовалась рукопись XVII в., принадлежащая Обществу истории и древностей. В описи сообщается, что в 1770 г. деревянный храм во имя князей Бориса и Глеба и деревянная гробница Иакова были разобраны по указу Костромской духовной консистории, а образ с гробницы отправлен на хранение в архиерейскую ризницу. Среди монастырских икон игуменья особенно выделяет икону Иакова «древняго письма, выш. в один аршин и пять вершков, шир. в 15 вершков. Риза на иконе из медной фольги. Венец серебряный 84-й пробы, весом в 52 золотника. Икона находится в притворе соборного храма, записана в главной описи под №185-5» (Государственный архив Костромской области, указанные иконы не сохранились).