В 1983–1996 гг. духовником монашеской общины был иеромонах Григорий (Папасотириу), с 1996 г. – иеромонах Паисий (Кирьяку) из келлии Благовещения Пресвятой Богородицы афонского монастыря Пантократор. В 1987–1991 гг. близ монастырских ворот был возведён новый кафоликон во имя преподобного Арсения Каппадокийского – храм афонского типа с внешним нартексом (лити) и двумя приделами во имя великомученицы Евфимии и Григория Паламы (проект: В. и Х. Малиокасы, Н. Муцопулос). Под ним расположены архондарик и церковная лавка, а позади находится могила старца Паисия. В старом кафоликоне ежедневно совершаются службы (кроме зимнего периода, когда богослужение проходит в парекклисионе св. Таксиархов). Монастырские здания расположены на обширной территории, засаженной фруктовыми и хвойными деревьями, для посадки которых ввиду каменистой почвы специально привозилась земля. В главном монастырском трёхэтажном корпусе (1967 г., расширен в 1971 и 1974 гг., реконструирован в 1979–1984 гг.) размещены кельи, парекклисион св. Таксиархов, трапезная, синодикон (зал для торжественных собраний), иконописная и швейная мастерские, другие хозяйственные помещения. Справа от ворот находится гостиница (1997–1999 гг.), за ней – парекклисион в честь иконы Божьей Матери «Живоносный Источник» (1970 гг.), к востоку от главного монастырского корпуса – кладбищенский храм Всех святых, с южной стороны старого кафоликона – корпус, в котором размещены библиотека, мастерские и кельи. Кроме того, в монастыре были построены кафизмы, мастерские и различные хозяйственные помещения. В 1996 г. в монастыре Иоанна Богослова подвизалось 52 сестры, в 2009 г. – 67 монахинь; с момента основания обитель возглавляла игуменья Филофея (Самара). Насельницы занимаются иконописанием, золотым шитьём, переводами и изданием книг, в том числе сочинений старца Паисия Святогорца. Святыни: частица Честного Креста Господня, мощи преподобного Арсения Каппадокийского, частицы мощей праведной Анны, Трёх святителей, Николая Чудотворца, Пентапольского митрополита Нектария Эгинского и др. Престольные праздники: дни памяти апостола Иоанна Богослова (26 сентября и 8 мая), равноапостольных Константина и Елены (21 мая), Арсения Каппадокийского (10 ноября).