С 1950 г. – епископ Сан-Францисский и Западноамериканский. Посещал русские приходы в странах Южной Америки, заведовал заграничными делами Американской митрополии. Во время войны в Корее в июле 1953 г. совершил визит в Сеул с целью передать благословение православным воинам, которые находились в американских частях в составе войск ООН, а также посетить разрушенную в ходе боёв Корейскую духовную миссию. В 1961 г. Иоанн был возведён в сан архиепископа. В 1954–1968 гг. представлял Православную Американскую митрополию в Центральном комитете Всемирного Совета Церквей. Иоанн интересовался событиями в России, встречался с бывавшими в США соотечественниками. В 1967 г. написал предисловие к книге Михаила Афанасьевича Булгакова «Мастер и Маргарита» (Париж, 1967 г.), в 1971 г. – к сборнику стихов Александра Аркадьевича Галича «Поэма России: Стихи и песни советского подполья» (Париж, 1971 г.), а в 1980 г. – к труду протоиерея Александра Меня «Таинство, Слово и образ: Богослужение Восточной Церкви» (Брюссель, 1980 г.). В мае 1975 г. ушёл на покой, жил в Санта-Барбаре. По-прежнему выступал на радио, вёл переписку, в том числе с протоиереем Александром Менем. Продолжал литературное творчество под псевдонимом Странник. Иоанн – автор многочисленных трудов, в которых тесно переплетались вопросы христианской веры, всемирной и русской культуры, судьбы России и её народа в ХХ в. Как духовный писатель обращался, главным образом, к жанрам апологетических бесед, адресованных широкому кругу читателей, и литературному портрету; размышлениям о выдающихся русских писателях, о влиянии их творчества на духовную жизнь страны. Эссе, написанные Иоанном, опираются на традиции агиографии и пастырских поучений, обращённых к верующим, на авторитет Священного Писания, они краткие и имеют нравственно-проповедническую направленность. Цель автора – показать в действии силу заповеди: «Ищите, прежде всего, Царства Божия и правды Его, и это всё приложится вам» (Мф. 6:33). Работы Иоанна издавались на русском, английском, немецком, сербском, итальянском и японском языках. Похоронен на сербском православном кладбище Санта-Барбары.