В 1928 г. Иоанн посетил Охридского епископа Николая (Велимировича), который стал для него образцом «служения апостольства наших дней, пастырем, чуждым условностей, стремящимся к непосредственности веры». Дружба Иоанна с епископом Николаем продолжалась до конца его дней. Иоанн пропагандировал идею «белого иночества» – тайные пострижения в монашество женщин, которые оставались жить в миру. Для расширения миссионерской деятельности организовал книгоиздательство «За Церковь!», которое называл православно-миссионерским. В издательстве были опубликованы избранные тексты творений св. отцов, отрывки из дневника Иоанна Кронштадтского, детская церковная литература, богослужебные книги и др. На ротаторе (механическом копировальном аппарате) Иоанн печатал для паствы миссионерские «Белоцерковские листки». Вскоре вышел первый сборник его статей «Церковь и мир» (Белая Церковь, 1929 г.), публиковавшихся ранее в выпусках одноимённой русской газеты в Белграде. Иоанн также издал два выпуска газеты «Борьба за Церковь» (подзаголовок «Однодневная газета борьбы за Русское Духовное Восстановление»). Проводившиеся им тайные пострижения не были одобрены архиерейским Синодом РПЦЗ. В 1931 г. митрополит Антоний (Храповицкий) запретил Иоанну печататься в парижских журналах «Путь», «Вестник Русского студенческого христианского движения», «Сергиевские листки», а также писать рецензии на книги, издававшиеся YMKA-Press. В июне 1931 г. Иоанн перешёл в юрисдикцию главы Западноевропейского Экзархата русских приходов Константинопольского патриархата митрополита Евлогия (Георгиевского). Причины перехода Иоанн изложил в брошюре «Почему я ушёл из юрисдикции митрополита Антония» (Париж, 1931 г.). Митрополит Евлогий благословил Иоанна заниматься миссионерством на Сергиевом подворье в Париже. В конце июля 1931 г. Иоанн по поручению митрополита Евлогия служил разъездным священником походной церкви: ездил на автомобиле окормлять русские общины, удалённые от храмов; стал одним из организаторов православного прихода в пригороде Парижа Аньере, первым настоятелем аньерской церкви во имя Всемилостивого Спаса. Первые богослужения совершались в зале музея лейб-гвардии Казачьего полка в Аньере.