На первом допросе перед патриархом Адрианом Игнатий отрицал факт разговоров с Г. Талицким. Однако на очной ставке с тем признался, что слышал от него «поносные слова о государе» и тетради просил, «чтобы истину познать». В патриаршей крестовой палате перед патриархом и архиереями Игнатий покаялся и заверил, что «совета с Гришкою» у него не было, тетради читал, «поносные слова» слушал, но не распространял и не поддерживал эти взгляды, но хотел всё узнать в деталях и доложить патриарху. Исследователи полагают, что в начале расследования патриарх Адриан пытался прекратить дело в отношении Игнатия, но это ему не удалось. В ходе дальнейших допросов Игнатий признал передачу денег Г. Талицкому и получение от него тетрадей, но категорически отрицал проявление сочувствия его учению о Петре антихристе. Игнатий сказал, что советовал Григорию показать тетради Суздальскому митрополиту Илариону. Г. Талицкий это подтвердил и заметил, что не пошёл в Суздаль, т.к. не имел денег. Исследователям трудно судить, насколько Игнатий разделял взгляды г. Талицкого, но утверждают, что архиерей принадлежал к числу традиционалистов, недовольных происходившими в России переменами. Обвинённый в сочувствии «раскольничьим мнениям» (представление об уже пришедшем антихристе и отождествление его с Петром I были широко распространены среди старообрядцев на рубеже XVII и XVIII вв.), Игнатий был лишён сана, расстрижен и отлучён от церкви. Как мирянин (в публикации Г.В. Есипова «Иван Андреев сын Шалгин»), он был подвергнут пыткам, но дал те же показания, что и прежде. Бывший архиерей, как и Г. Талицкий, был приговорён к смертной казни, которая в отношении Игнатия была заменена заключением в Соловецком в честь Преображения Господня монастыре. Бывшего Тамбовского епископа привезли на Соловки в январе 1702 г. вместе с ещё одним осуждённым по делу Г. Талицкого – священником Иоанном Иоанновым, которого было приказано постричь в монашество. В грамоте Холмогорского архиепископа Афанасия (Любимова) от 22 декабря 1701 г. говорится, что «расстрига Ивашко Шангин (Игнатий)» должен быть помещён в монастыре в Головленкову башню и держать его там следует «до кончины живота его неисходно». Запрещалось давать ему бумагу и чернила, принимать и передавать письма, а если письма будут появляться, их следовало отправлять в Преображенский приказ. Игнатий скончался в тюрьме (дату смерти без указания источников привёл П.М. Строев).