Когда «правила» после доработки были утверждены, Олонецкая духовная консистория 19 декабря 1836 г. издала указ «Об открытии училищ для детей поселян и раскольников по Олонецкой епархии». Учебные пособия на приходы были разосланы через духовные правления. К концу 1840 г. занятия с детьми велись в 85% сельских приходов епархии, число учащихся превысило 2 тыс. человек. Два раза в год благочинные проводили испытание учеников и представляли архиерею отчёт. Регулярно совершая объезды епархии, Игнатий экзаменовал детей и награждал отличившихся книгами. В 1840 г. по его представлению Синод преподал благословение с грамотами всем клирикам епархии, принявшим участие в «обучении поселянских детей грамоте». Для повышения уровня знаний духовенства Игнатий посылал причтам книги и даже «Земледельческую газету». Игнатий развивал миссионерскую деятельность, поскольку в епархии свыше трети населения принадлежало к старообрядчеству, во многих местах сохранялись празднества языческого происхождения. 29 июня 1829 г., после окончания литургии в день апостолов Петра и Павла, Игнатий выступил с обличением языческого праздника Ивана Купалы, проповедь имела успех. Игнатий посещал старообрядческие скиты, вёл полемику со старообрядцами, сумел расположить к себе многих беспоповцев. В 1831 г. по представлению Игнатия было открыто семь новых приходов в Повенецком уезде вблизи скитов, в январе 1832 г. он освятил устроенные храмы. К середине 1830 гг., после того как были установлены имена всех старообрядцев по приходам и в скитах, разработал комплекс мер по их воссоединению с православной церковью. Составил подробное предписание священникам о том, как вести обращение старообрядцев. Священники обязаны были брать подписки у присоединяемых, заверять их и отсылать в консисторию. Для удержания «раскольников от продерзательств» Игнатий обращался за помощью в полицию. Так, в Валдиевском приходе Каргопольского уезда старообрядцы призывали крестьян отказаться от самообложения на постройку церкви, за что подстрекателей приговорили к телесному наказанию. Со старообрядческих часовен по распоряжению правительства были сняты все колокола, которые «перешли в достояние православной Церкви как принадлежность её одной».