Были изысканы средства на содержание четырёх епархиальных миссионеров, в Оренбургской духовной семинарии в качестве обязательных предметов были введены татарский язык и основы ислама. В связи с усилением активности сектантов в Тургайской области были организованы миссионерские курсы в Оренбурге и Кустанае. Иоаким приложил большие усилия по обращению в единоверие старообрядцев (уральских казаков и иногородних). Всего в епархии было образовано более 50 единоверческих приходов, где Иоаким служил по старопечатным книгам. Содействовал открытию епархиального женского училища в Челябинске. 13 августа 1910 г. назначен епископом Нижегородским и Арзамасским. При Иоакиме в епархии была усилена миссионерская и противосектантская деятельность, учреждена должность епархиального противосектантского миссионера. С началом Первой мировой войны был создан епархиальный комитет помощи раненым. Практически во всех монастырях Нижегородской епархии были открыты лазареты и приюты для беженцев и осиротевших детей. Иоаким организовал помощь монастырям и духовным учебным заведениям, эвакуированным на территорию епархии из прифронтовой полосы. 6 мая 1916 г. возведён в сан архиепископа. В том же году вызван как член присутствия зимней сессии Святейшего Синода. Награждён орденами св. Анны третьей (1895 г.) и первой (1904 г.) степени, св. Владимира второй степени (1908 г.), св. Александра Невского (1913 г.), черногорским орденом св. Даниила первой степени (1900 г.). 15 апреля 1917 г., после Февральской революции, решением обер-прокурора Владимира Николаевича Львова в числе других членов Синода уволен от должности. Вместе с Киевским митрополитом Владимиром (Богоявленским), архиепископами Литовским Тихоном (Беллавиным; впоследствии Патриарх Московский и всея России), Новгородским Арсением (Стадницким) и Гродненским Михаилом (Ермаковым) подписал заявление о несогласии с действиями светских властей и о необходимости канонической организации нового состава Синода. Был отстранён от управления епархией, некоторое время находился под домашним арестом. Взял отпуск для участия в поместном Соборе Православной Российской Церкви 1917–1918 гг. 10 апреля 1918 г. указом патриарха Тихона и Синода уволен на покой с назначением настоятелем новоиерусалимского в честь Воскресения Христова мужского монастыря. Оставался членом поместного Собора. Выехал в Крым к сыну Николаю. Получившие распространение известия о казни Иоакима большевиками в 1918 г. исследователям представляются ошибочными. По сообщению Таврического и Симферопольского епископа Димитрия (Абашидзе), Иоаким был убит в начале 1921 г. грабителями в окрестностях Севастополя.