18 мая 1972 г. патриархом Пименом награждён правом ношения второго креста с украшениями. В августе 1972 г. Иероним был отозван из Иерусалима, 11 октября того же года назначен наместником Троице-Сергиевой лавры. С 12 ноября 1973 г. по сентябрь 1978 г. преподавал в Московской духовной семинарии Священное Писание Нового Завета. По воспоминаниям Марка Харитоновича Трофимчука, в годы наместничества Иеронима количество братии увеличилось до ста человек. Больше половины иноков обители приняли постриг от Иеронима. Он добился постоянной прописки братии в Троице-Сергиевой лавре. 2 сентября 1977 г. патриархом Пименом Иероним был награждён патриаршим крестом. Провёл реставрационные работы во всех храмах Троице-Сергиевой лавры, особенно масштабные в Сергиевском трапезном храме. При нём были построены два новых придела во имя Иннокентия (Вениаминова; освящён в 1977 г.) и в честь всех Радонежских святых (освящён 11 июня 1981 г.) в южном и северном нефах крипты Успенского собора. В 1980 г. в связи с празднованием 600-летия Куликовской битвы патриарх Пимен наградил Троице-Сергиеву лавру орденом Сергия Радонежского первой степени, вручив его Иерониму. Иероним был награждён орденами св. Владимира второй степени, Сергия Радонежского второй степени и медалью, орденом Гроба Господня первой (1981 г.) и второй (1972 г.) степени (Святогробское братство Иерусалимский Патриархат), орденом святых апостолов Петра и Павла (1981 г.; Антиохийский патриархат). Принимал в Троице-Сергиевой лавре Иерусалимского патриарха Диодора (1981 г.) и Антиохийского патриарха Игнатия IV (1981 г.). 28 марта 1982 г. в четвёртую неделю Великого поста Иероним последний раз совершил Божественную литургию и пассию. После кончины отпевание в Сергиевском трапезном храме 1 апреля 1982 г. возглавил патриарх Пимен. Иероним похоронен в Троице-Сергиевой лавре у алтарной апсиды Свято-Духовского храма.