Понятие «интердикт» окончательно входит в употребление при папе Римском Иннокентии III, который в 1198 г. в послании к Памплонскому епископу Гарсии писал об общем локальном интердикте (generale interdictum terre), наложенном на Арагонское и Наваррское королевства из-за войны между испанскими королями. При Иннокентии III локальный интердикт стал применяться очень часто: папой или его легатами интердикту были подвергнуты королевства Леон, Норвегия (в 1198 г.), Франция (в 1199/1200 г.), Венеция (в 1204 г.), Англия (в 1208 г.) и др. Интердикт активно использовался Папским престолом и правящими епископами, в том числе в политических целях, при конфликте со светскими властями. В то же время право общего локального интердикта (interdictum generale locale), налагавшегося на государство, провинцию или архиепископство, было сохранено только за Папским престолом. Уже папа Римский Гонорий III (1216–1227 гг.) отменил интердикт, наложенный латинским Константинопольским патриархом Гервасием на владения герцога Виллардуэна Ахейского. Наряду с общим локальным интердиктом с XII в. развиваются и другие формы интердикта, в том числе частный локальный интердикт (interdictum particulare locale), который налагался на приход, церковь или собор, а позднее – на отдельные алтари (на которых запрещалось совершение мессы), кладбища и т.д. Одним из первых различие между формами общего и частного локального интердикта в 1199 г. обозначил папа Иннокентий III в декреталии к испанским епископам. Как правило, частный локальный интердикт использовался в качестве меры наказания для местных клириков, выражавших непослушание высшей церковной власти; например, в 1203 г. такому интердикту папа Иннокентий III подверг кафедральный собор в Клермоне и другие церкви города, принадлежавшие соборному капитулу, вследствие конфликта его каноников с правящим епископом города. Схожей с частным локальным интердиктом и часто соединявшейся с ним санкцией для клириков являлся запрет на совершение общественных богослужений (cessatio a divinis), не являвшийся при этом полным запрещением священнослужения (suspensio a divinis); право подвергать непослушных клириков подобному наказанию было закреплено за правящим епископом седьмым каноном  четвёртого Латеранского собора (1215 г.). Помимо отдельных конфликтов между светской властью и Папским престолом, вызывавших объявление локального интердикта, в каноническом праве постепенно оформляются общие случаи, когда такое наказание накладывалось «в силу права» (a jure).