Габсбурги остались верны католической церкви, приложив усилия к тому, чтобы восстановить её позиции и авторитет. Карл V был увлечён идеей создания универсальной монархии (monarchia universalis) – системы власти, которая позволила бы преодолеть раздробленность Европы, полагая, что политическое господство единого монарха обеспечит мир внутри христианского сообщества и мобилизацию сил для борьбы с османской угрозой. Противоречия между интересами Габсбургов и Франции, их борьба за доминирование в Европе привели к Итальянским войнам (1494–1559 гг.). Вместе с тем в религиозной политике Карла V прослеживается стремление к подчинению церкви монарху и меньшей её зависимости от Рима. Карл V стремился к централизации составных частей империи и, вероятно, к установлению в Германии национальной церкви на манер Франции (см. Галликанизм). Впервые столкнувшись с учением Мартина Лютера на Вормсском рейхстаге (1521 г.) и принимая решение о запрещении нового учения и преследовании его адептов, император рассчитывал на поддержку папы Льва X. Однако на территории Римско-Германской империи, в том числе и в Австрии, Вормсский эдикт, как правило, не выполнялся. В 1523 г. эрцгерцог Фердинанд издал указ против последователей М. Лютера и одновременно поручил Венскому епископу Иоганну Ревеллису возглавить судебную курию против еретиков. Одна из статей Мадридского мира с Францией (1526 г.) предусматривала совместные действия французского короля и императора по искоренению лютеранства. Но Франция, папа Климент VII, Англия, Венеция, Флоренция и Милан, опасавшиеся усиления императора, объединились в Коньякскую лигу (1526–1529 гг.) и не позволили приступить к реализации проекта. На Шпайерском рейхстаге (1526 г.), наоборот, было принято решение о возможности свободно выбирать веру до решений будущего Собора. В 1527 г. император взял реванш, допустив, несмотря на формальное осуждение, захват и разграбление Рима наёмными войсками (Sacco di Roma), заняв большую часть папских владений и нанеся поражение французским войскам у Неаполя (1528 г.). Были заключены мирные договоры с папой Римским (Барселонский мир, май 1529 г.) и французским королём Франциском I (Камбре, август 1529 г.), где также декларировались намерения совместной и решительной борьбы с ересью. Вернувшись в Германию, Карл V издал эдикт против лютеран, игнорируя компромисс, достигнутый в 1526 г. На Шпайерском рейхстаге (1529 г.) лютеране заявили протест против попыток навязать им позиции католич. большинства рейхстага и отказались подчиниться императору; он был готов прибегнуть к силе. Но этому помешала осада турками Вены (1529 г.). Болонский мир (1530 г.) между Карлом V и папой Климентом VII и последовавшая за ним императорская коронация Карла не привели к примирению сторон.