Живя ещё в Москве, А.Д. Галахов стал преподавателем во втором специальном классе первого кадетского корпуса, причём ему было поручено неофициальное наблюдение за преподаванием русского языка и словесности во всех Московских корпусах. В 1856 г. по предложению начальника военно-учебных заведений Я.И. Ростовцева А.Д. Галахов занял кафедру русского языка и словесности в Николаевской академии генерального штаба, для чего и оставил Москву, где прожил 34 года, и переселился в Петербург. Здесь А.Д. Галахов принимал деятельное участие по устройству Литературного Фонда и на первом заседании членов-учредителей (8 ноября 1859 г.) был выбран секретарём и исполнял эту обязанность до 2 февраля 1861 г., после чего состоял членом этого общества до 1869 г. Кроме лекций, он занялся составлением двух капитальных трудов: «Исторической хрестоматии нового периода русской словесности» (в двух томах) и «Истории русской словесности древней и новой», так же в двух томах (во втором томе две части), напечатанных в 1863–1875 гг. (последний труд Академия Наук удостоила премии графа Сергея Семёновича Уварова). В 1863 г. А.Д. Галахов был назначен членом учёного комитета Министерства народного просвещения, а в 1865 г. избран в ординарные профессора Санкт-Петербургского историко-филологического института. Полезную деятельность А.Д. Галахова Московское общество любителей российской словесности почтило избранием его в 1867 г. в действительные члены, в 1868 г. Академия Наук избрала его в члены-корреспонденты по второму отделению, «в уважение к учёным трудам». В Московском обществе испытателей природы А.Д. Галахов состоял в бытность свою ещё в Москве. Кроме того, в этом же году он был приглашён Святейшим Синодом в число членов временной комиссии по пересмотру существующего и начертанию нового устава духовных академий. В 1882 г. А.Д. Галахов, по прошению, уволился от должности профессора историко-филологического института, продолжая до самой смерти заниматься в учёном комитете Министерства народного просвещения и в Академии генерального штаба. За последнее время лекции А.Д. Галахова представляли живую летопись литературы: ему приходилось говорить не о деятелях русского слова, а о своих умерших друзьях и неприятелях, о том мире, в котором он жил, который составлял и его прошлую жизнь. В свою очередь, слушателям было любопытно видеть свидетеля отдалённого прошлого, видевшего своими глазами А.С. Пушкина, приятеля В.Г. Белинского, А.А. Кудрявцева, А.А. Грановского и других, преданного всей душой их светлой памяти до конца жизни. Всё это время А.Д. Галахов не переставал сотрудничать в периодических изданиях. Кроме участия в вышеуказанных журналах и газетах, помещал свои статьи в «Атенее» Евгения Фёдоровича Корша, «Библиографических записках» Александра Николаевича Афанасьева, «Русском вестнике», «Современнике» (редакции Николая Алексеевича Некрасова и Ивана Ивановича Панаева), «Вестнике Европы», «Санкт-Петербургских ведомостях» (редакции Андрея Александровича Краевского и Валентина Фёдоровича Корша), «Новом времени», «Журнале министерства народного просвещения», «Историческом вестнике», «Русской старине» и др. По словам самого А.Д. Галахова, «всех статей нет возможности указать: так их много».