В 1913 г. был приобретён участок, именуемый «Камень сидения», связанный, по преданию, с пребыванием Пресвятой Богородицы в Айн-Кареме. В отчёте 1914 г. указана только стоимость участка – 5100 руб., с примечанием: «Уплачено из сумм Горненского монастыря 3232 руб. 72 коп.». Будучи архитектором по образованию, архимандрит Леонид, как и архимандрит Антонин, сам проектировал постройки, что вызывало нарекания петербургских властей. С другой стороны, активное строительство и бесконтрольный рост числа насельниц привели к оскудению обители и перманентному финансовому кризису. Резервный капитал общины, составлявший к 1911 г. 71 510 руб., был в последующие три года полностью израсходован, притом что общий долг РДМ составлял 124 тыс. руб. Сёстры голодали и были вынуждены добывать средства к существованию тяжёлой физической работой, обеспечивавшей монастырю минимальный доход: в 1911 г. – 9763 руб., в 1912 г. – 15 859 руб., в 1913 г. – 6175 руб. Если разделить эти суммы на 200 человек (именно столько насельниц проживало к 1914 г. в Горненском монастыре), в среднем сёстры при растущей дороговизне должны были жить на 4 руб. 40 коп. в месяц. Во время Первой мировой войны в связи с выступлением в 1914 г. Турции на стороне Германии и Австро-Венгрии русские учреждения в Святой земле были закрыты, персонал частично эвакуирован, частично интернирован. Монахини Горненского монастыря и Елеонского Вознесенского монастыря, за исключением самых старых и немощных, выехали в Александрию и вернулись только в 1918 г. В Александрии скончалась в 1918 г. старшая сестра Горненской общины Валентина, общину возглавила монахиня Тавифа (в миру Татьяна Минина). 26 ноября 1919 г. управлявший русскими учреждениями в Палестине Н.Р. Селезнёв в донесении Совету ИППО писал: «В Иерусалиме… около 450 человек паломниц и монахинь. Церкви открыты, ризница сохранилась... На Елеоне живёт 120 сестёр, в Горнем 70, службы везде справляются». Поддерживать административную связь с Московской патриархией стало трудно; русские храмы и монастыри в Святой земле оказались в ведении Русской православной церкви за границей (РПЦЗ). Архиерейский Синод решил реорганизовать Горненский монастырь, поставив во главе общины настоятельницу в сане игуменьи. Ей стала Тавифа I, управлявшая обителью до 1945 г. В 1945 г., после визита в Святую землю патриарха Алексия I, среди сестёр Горненского монастыря возникло разделение по вопросу юрисдикции, появилась большая группа «патриарших» сестёр, т.е. сторонниц перехода в юрисдикцию Московской патриархии. Их число увеличилось после того, как начальник РДМ в юрисдикции РПЦЗ архимандрит Антоний (Синькевич) отстранил от управления монастырём всеми почитаемую игуменью Тавифу и назначил вместо неё новопостриженную монахиню Елисавету (Анненкову). Просьбы сестер вернуть игуменью ни к чему не привели. Иерусалимский патриарх Тимофей, узнав о нестроениях в обители, назначил настоятельницей 75-летнюю Антонину (Гришко). Архимандрит Антоний запретил «своей» игуменьи и «своим» сёстрам общение с «патриаршими» и опечатал Казанский храм обители. Тогда Иерусалимская патриархия предоставила в распоряжение «патриарших» сестёр греческий храм в Айн-Кареме, назначив туда для совершения богослужений на церковнославянском языке русскую иеромонахиню Исаию.