«Декрет Грациана» стал первым общеизвестным и общепринятым сборником церковных законов (в XII в. он даже был переведён на старофранцузский язык). Во второй половине XII в. он постепенно вытеснил из употребления более ранние своды канонов. Последующие своды церковного права – сборники папских декреталий (складывавшиеся во второй половине XII – начале XIII в.) – создавались как добавления к «Декрету Грациана». В последней трети XII в. из среды изучавших и комментировавших «Декрет Грациана» церковных юристов (декретистов) выделились первые составители и комментаторы сводов папских декреталий – декреталисты. Изучение истории создания «Декрета Грациана» началось в XVI в. Юристы А. де Муши, Ш. Дюмулен, А. Контий, А. Огюстен и др., подготавливая документ к изданиям, проделали работу по устранению ошибок и разночтений в тексте и заложили основы источниковедческой критики «Декрета Грациана». Созданная в 1566 г. папой Римским Пием V (1566–1572 гг.) для издания «Corpus iuris canonici» комиссия римских корректоров (Correctores Romani) также провела разыскание и сличение древних рукописей «Декрета Грациана». Значительная часть входящих в документ канонов признавалась и некоторыми протестантскими церквами, поэтому до начала ХХ в. он являлся предметом активного изучения как католических, так и протестантских канонистов и теологов. Именно протестантскими исследователями Ю.Х. Бёмером (1747 г.), Э. Рихтером (1839 г.) и Э. Фридбергом (1879 г.) были осуществлены лучшие в критическом источниковедении XIII–XIX вв. издания «Декрета Грациана». Во второй половине XIX – XX вв. началось изучение и издание комментариев и сумм на «Декрет Грациана». В 1930 гг. Ш. Куттнер, исследовав несколько сот рукописей документа, описал как особый жанр юридической литературы «transformationes» («переработки») «Декрета Грациана», в которых декретисты не только комментировали, но и перегруппировывали текст, вставляли в него новые каноны. В середине XX в. польский исследователь А. Ветулани, основываясь на анализе анонимного итальянского сочинения XII в., называемого в историографии по первым словам «Gratiani opus eggregium» (сокращённый вариант «Декрета Грациана» – «Аbbreviatio»), выдвинул гипотезу о том, что сочинение магистра Грациана было значительно меньше по объёму, чем текст в редакции XVI в.; оно датируется не серединой, а первой четвертью XII в. и создавалось для защиты позиций Римского папы в борьбе за инвеституру, по всей вероятности, ещё до Вормского конкордата (1122 г.).