В 1654 г. над мощами святого построили тёплую трапезную церковь в честь иконы Божьей Матери «Знамение», в которой находились рака Галактиона и его вериги. По благословению архиепископа Варлаама было составлено Житие преподобномученика. Василий Осиопвич Ключевский считал его автором одного из иноков Свято-Духова монастыря. В 1652 г. монастырский казначей Ефрем и братия дополнили Житие описанием происшедшего в том же году чуда. В.М. Верюжский полагал, что Житие святого было создано примерно через 15 лет после его смерти и впоследствии, при Вологодском архиепископе Симоне (1664–1684 гг.), пополнилось описанием 18 чудес. Судя по отписке архиепископа Симона Сарскому и Подонскому митрополиту Павлу (апрель 1673 г.), работа над новым текстом Жития шла между 1667 и 1673 гг. В 1717 г. клирик Вологодского архиепископа Гавриила И. Слободской (автор «Вологодского летописца») составил новую редакцию Жития Галактиона и канон святому. Исследователям известно несколько списков Жития Галактиона (различаются, в первую очередь, по числу включённых в них чудес): Российской национальной библиотеки (XVII в.); Исторического музея (конец XVII – начало XVIII вв.); Российской государственной библиотеки (1760–1761 гг.; отражает наиболее поздний этап существования текста, сильно сокращён); Российской государственной библиотеки (после 1824 г.). Выписки из Жития в редакции И. Слободского сохранились в качестве сопроводительного текста к картинам вологодских художников К.М. Козлова, А.И. и И.А. Скрипицыных (1861 г.), находившимся в часовне Свято-Духова монастыря (Вологодский историко-архитектурный и художественный музей-заповедник). В Житии отмечено 18 случаев исцеления по молитвам святого. Люди верили, что Галактион помогает избежать неурожая. В 1655 г., когда в Вологде долгое время шли проливные дожди, архиепископ Маркелл возглавил крестный ход к могиле преподобномученика. После службы небо прояснилось, и настала тёплая, солнечная погода. В память об этом чуде по благословению архиепископа Маркелла был установлен ежегодный крестный ход (Российская государственная библиотека). Отписка Вологодского архиепископа Симона Сарскому митрополиту Павлу свидетельствует, что в XVII в. вопрос о канонизации Галактиона поднимался неоднократно. В 1667 г. на Большом Московском Соборе архиепископ Симон предлагал для свидетельствования Житие Галактиона и других Вологодских святых. Собор постановил «толко в поминовение о них в обителех их творити». В 1669 г. настоятель Свято-Духова монастыря игумен Сергий просил патриарха Иоасафа II об освидетельствовании мощей Галактиона и о дозволении вместо панихиды петь ему молебны. Патриарх Питирим предписал в 1673 г. произвести освидетельствование мощей и дознание о чудесах преподобномученика.