В сложных случаях викарий должен был обращаться к епархиальному архиерею, все финансовые вопросы деятельности викариатства решались в Ставрополе. К концу 1916 г. в Кубанской области насчитывалось около 500 приходов. 22 января 1917 г. Кубанский и Екатеринодарский епископ Иоанн, обратившись к пастырям, священно- и церковнослужителям с призывом поддерживать в народе благочестие, сказал, что «ныне свершается суд Божий над нашей многострадальной Родиной». 22–23 марта 1917 г. по предложению епископа Иоанна состоялся съезд благочинных Кубанской области в связи «с текущими великими историческими днями», на котором было запланировано проведение 13 апреля съезда Кубанской епископии для рассмотрения устава Ставропольской епархии. На собрании духовенства Ейска и ряда станиц Кубанской области, состоявшемся на пасхальной неделе 1917 г., подавляющим числом голосов было поддержано пожелание установить в России конституционную монархию. На прошедшем в мае 1919 г. в Ставрополе Южнорусском соборе было принято решение «о признании выделения Кубанского викариатства из Ставропольской епархии неотложно необходимым». 18 июня того же года Временное высшее церковное управление на Юго-Востоке России издало указ о преобразовании Кубанского викариатства в самостоятельную епархию с оставлением наименования «Преосвященный епископ Кубанский и Екатеринодарский». В 1922 г. в Кубанской епархии началось распространение обновленчества, в раскол уклонился Кубанский епископ Иоанн (Левицкий). С 24 июля по 21 августа 1922 г. обновленческой Кубанской епархией управлял Николай (Федотов), бывший настоятель ейского Михаило-Архангельского собора, благочинный церквей Ейска, носивший титул «епископ Ейский (Новороссийский)». В начале 1920 гг. было, как полагают исследователи, возобновлено православное Ейское викариатство. Есть сведения, что 29 ноября 1920 г. во епископа Ейского был хиротонисан Филипп (Гумилёвский), вскоре арестованный, затем сосланный в Нижний Новгород. В конце 1921 г. епископом Ейским, викарием Кубанской епархии, был назначен Евсевий (Рождественский), прибывший в Ейск в январе 1922 г. (исследователи считают недостоверными сведения о хиротонии 4 ноября 1921 г. во епископа Ейского Василия (Ратмирова), вскоре уклонившегося в обновленчество). Когда Кубанский епископ Иоанн (Левицкий) перешёл в обновленчество, епископ Евсевий объявил архиепископа Иоанна впавшим в раскол и взял на себя управление Кубанской епархией, организовал епархиальный совет. В мае 1922 г. епископ Евсевий прибыл в Краснодар, 4 января следующего года был арестован по обвинению в «противодействии изъятию церковных ценностей». В 1925–1926 гг. епископом Ейским был Кирилл (Соколов). С 17 ноября 1931 г. по 22 ноября 1933 г. обязанности епископа Ейского, викария Кубанской епархии, временно управляющего Ростовской епархией, выполнял Николай (Амасийский). Ейское викариатство было возрождено в 2005 г.: 3 апреля того же года в храме Христа Спасителя Патриарх Московский и всея Руси Алексий II возглавил хиротонию Тихона (Лобковского) во епископа Ейского, викария Екатеринодарской и Кубанской епархии. Епископ Тихон, имеющий местопребывание в Краснодаре, помогает митрополиту Исидору (Кириченко) в управлении Екатеринодарской епархией.