Имя Елисея отсутствует и в синодике патриаршего Новинского Введенского Богородицкого монастыря в Москве, переписанного в 1645/1646 г., хотя имя его отца Анисима здесь записано дважды. По сообщению архимандрита Леонида (Кавелина), в конце XIX в. Елисей почитался местно. Канонизация Елисея подтверждена включением его имени в Собор Ростово-Ярославских святых, учреждённый в 1964 г. по инициативе архиепископа Ярославского и Ростовского Никодима (Ротова), и в Собор Радонежских святых, празднование которому установлено 10 июля 1981 г. по благословению Патриарха Московского и всея Руси Пимена. Описание внешнего облика Елисея встречается в тексте иконописного подлинника конца XVIII в. в отдельном перечне учеников Сергия Радонежского без указания дня памяти: «Сед, брада поменше и уже Николиной, ризы преподобническия» (Библиотека Академии Наук). В рукописи 1820 гг. под 14 июня он уподобляется своему учителю: «Брада поменши Сергиевы, власы с ушей, риза преподобническая» (Российская национальная библиотека). В составе композиции Собора Радонежских святых Елисей представлен в нижнем ряду вторым справа, между преподобными Михеем Радонежским и Максимом Греком, на иконе «Преподобный Сергий Радонежский с учениками в молении Святой Троице» конца XVII в., написанной в мастерской Троице-Сергиева монастыря (Сергиево-Посадский музей-заповедник). Он изображён вполоборота влево, в красноватой рясе, коричневой мантии и зелёном парамане, с куколем на плечах, с волнистыми волосами и седоватой бородой средней величины, правая рука на груди, левая в молении; вверху на окладе гравированная надпись: «Прп(д)бны елисеи». В XIX в. в храмах Троице-Сергиевой лавры образ Елисея вводился в монументальный ряд изображений Радонежских чудотворцев. Так, его полуфигура, в мантии и голубой епитрахили, со сложенными крестообразно на груди руками с чётками, с седой округлой бородой и ниспадающими на плечи прядями волос, помещена в стенописи церкви Явления Божьей Матери Сергию Радонежскому (Михеевской; 1842 г.?, поновления – 1871, 1947 гг.). В живописной манере выполнен также ростовой образ Елисея (руки с чётками на груди, длинные волосы на прямой пробор) вместе с Иоанникием Радонежским на оконном откосе северной стены трапезной части церкви Сергия Радонежского (1883 г., поновления – XX в.).