Прихожане, посещавшие службу по воскресным и праздничным дням, заказывали панихиды, которые служились в часовне перед распятием на могиле Мелании. Ежегодно в пятницу Светлой седмицы с иконой Божьей Матери «Живоносный Источник», в день Преполовения Пятидесятницы, в девятую пятницу после Пасхи и 1(14) августа совершались крестные ходы к св. источнику. Во вторник Светлой седмицы был крестный ход с Иверской иконой вокруг Знаменского храма. Во время эпидемии холеры в 1870 г. чудотворный Иверский образ носили по домам. 30 января 1890 г. в Елецком монастыре в двухэтажном доме на склоне горы у южных ворот открылась церковноприходская школа на сто мест для девочек. Воспитанницы бесплатно обучались грамоте и рукоделию. Учителями Закона Божия были монастырские клирики священник Николай Иванович Невский и дьякон Василий Онисимович Попов, грамоту и рукоделие преподавали монахини. В годы Первой мировой войны Елецкий монастырь открыл приют на двадцать мест для девочек из семей беженцев. В XIX – начале XX вв. сёстры Елецкого монастыря слыли самыми искусными кружевницами. В 1879 г. для обучения молодых послушниц в монастыре открылась живописная мастерская. При Знаменской церкви, по данным 1789 г., было кладбище, располагавшееся на юго-восточном мысе Каменной горы над рекой Ельчик. В 1879 г. на пожертвованной Елецкому монастырю купцом Василием Хренниковым земле (1,2 га) было устроено новое монастырское кладбище. На нём были погребены настоятельницы и сёстры, среди которых – Елисавета (Холина), Магдалина (Иванова) и затворница Мелания. Вскоре после кончины Мелании её могила стала местом паломничества. Сохранились свидетельства о чудесах, совершившихся после молитвенного обращения к ней, исцелениях, благодатной помощи от её портретов. Над могилой затворницы позднее была сооружена чугунная часовня, увенчанная позолоченным крестом. Накануне 1917 г. готовилась канонизация затворницы Мелании. Против главного алтаря Знаменского храма находилась могила монахини Олимпиады (Солнцевой), на левой стороне за алтарём Варлаама Хутынского – игумений Павлины и Клеопатры. Новое монастырское кладбище частично сохранилось до настоящего времени. Елецкий монастырь был крупным землевладельцем в Елецком и прилегающих к нему уездах. По прошению Митрофана 3 августа 1685 г. указом царей Ивана и Петра Алексеевичей и царицы Софьи Алексеевны «Рождественскому монастырю Курския Богородицы, что на Каменной горе» были пожалованы бывшие вотчины елецкого Троицкого монастыря: в Елецком стане пустоши на Сазыкиной поляне, Яблоновой поляне, Лепикиной поляне (всего 20 четвертей). В 1688 г. сёстрам Елецкого монастыря было пожаловано право собирать плату за перевоз через реки Сосна близ Ельца и Дон севернее Задонска. В 1770 г., после упразднения Елецкого монастыря, при Знаменском храме был открыт приход (29 дворов с 90 прихожанами мужского пола) Ламской и Чёрной слобод Ельца. Ко времени возобновления Елецкого монастыря в 1822 г. площадь монастырских строений составляла около 2 га. В 1854 г. Елецкий монастырь приобрёл из государственной казны 109 га земли в районе Вотковской дачи, 12 февраля 1866 г. с разрешения министра государственных имуществ из казённых земель монастырь получил дополнительно 54,6 га земли в Злобин-Воргольской даче Елецкого уезда, близ сёл Крутое и Нижний Воргол.