С 1929 г. сбор средств проходил ежегодно по подписным листам общества среди прихожан и духовенства. «Единение» ежегодно проводило летние и зимние общие съезды, которые являлись отчётами о проделанной работе и руководством к последующей деятельности. Летние съезды носили характер православного паломничества с ежедневным храмовым богослужением, общим говением и причастием. На зимнем съезде РПСЕ в декабре 1930 г. девичьи кружки объединились для помощи РПСЕ. В работе организации также помогали «Православное дружество учащейся молодёжи» («Гимназическое дружество», открывшееся осенью 1931 г.), Дамский комитет Просветительного общества в Риге (оказывал помощь в работе с детьми). В 1930 гг. латвийское правительство стало рассматривать РПСЕ как «филиал эмигрантского шовинистического РСХД», как организацию, которая готовит «предателей Латвии для будущей России». 20 июля 1932 г. Рижский отдел Политуправления МВД Латвии начал следствие по делу о деятельности РПСЕ. После происшедшего в Латвии 15 мая 1934 г. государственного переворота и прихода к власти Карлиса Ульманиса следствие по делу активизировалось. 31 июля того же года Политуправление МВД Латвии приняло документ, в котором обвинило РПСЕ в политической деятельности, в том, что оно находится под руководством эмигрантской организации, «цель которой – восстановление великой неделимой России», и потребовало ликвидировать его как организацию, «вредную интересам Латвийского государства». Трагическая гибель архиепископа Иоанна (Поммера) 12 октября полностью парализовала деятельность РПСЕ. По делу об убийстве архиепископа Иоанна (Поммера) было арестовано и допрошено всё руководство организации, но причастность его членов к убийству следствием не была установлена. 5 декабря МВД Латвии приняло решение о закрытии РПСЕ как нелояльной к Латвийскому государству организации. РСХД назвало случившееся «прискорбным недоразумением, основанным на неверной или даже тенденциозной информации о деятельности РПСЕ и РСХД за рубежом», и просило латвийское правительство произвести расследование и снять неверное обвинение, что сделано не было. С закрытием РПСЕ религиозно-педагогическая работа его членов продолжалась в рамках отдельных православных приходов, в которых бывшие единенцы руководили воскресными школами. Во время Второй мировой войны группа бывших единенцев участвовала в работе «Православной миссии в освобождённых областях России» (так называемой псковской миссии). В 1944–1952 гг. советской властью было арестовано и репрессировано 13 бывших членов организации, трое из которых (протоиерей К.И. Зайц, Г.В. Ильинский и М.А. Нитавский) погибли в сталинских лагерях. Многие бывшие единенцы стали священнослужителями – епископ Монреальский и Канадский Сильвестр (Харун), протоиерей Иоанн Трубецкой, протоиерей Алексий Ионов и др.