В совместном письме от 1099 г. к папе Римскому Пасхалию II Даиберт, Готфрид Бульонский и Раймунд Тулузский подробно описали перипетии Крестового похода, несчастья, постигшие крестоносцев в Палестине, а также конфликты, возникавшие между предводителями, особенно отметив столкновения с Боэмундом Тарентским из-за Лаодикии. Даиберт возглавил партию, выступавшую за создание в Святой земле духовных государств, которые находились бы в вассальной зависимости от Римского престола, представителем которого становился латинский Иерусалимский патриарх. Поддержав Раймунда Тулузского, Даиберт тем самым вступил в конфликт с Готфридом Бульонским, требуя в случае взятия Акры, Яффы и Кесарии крестоносцами передать их в независимое владение Раймунду или образовать из захваченных земель владение католической церкви. Позднее Даиберт заключил договор с Готфридом Бульонским о том, что, если в результате завоевания Египта будет создано светское королевство со столицей в Каире, Иерусалим и Яффа перейдут во владение католической церкви как отдельные владения. Однако планы завоевания Египта не были осуществлены. После смерти Готфрида Бульонского (1100 г.) Иерусалим фактически оказался под властью Даиберта, но, не имея поддержки среди духовенства и баронов, он был вынужден призвать к себе на помощь Боэмунда Тарентского. Сторонники создания светского государства провозгласили королём Иерусалима Балдуина I Бульонского (1100–1118 гг.), брата Готфрида, принудив Даиберта короновать его в Вифлееме. Новый король, духовенство и бароны Иерусалимского королевства, обвинив Даиберта в измене и заговоре, а также в агрессии против православных христиан, сместили его с патриаршего престола. Не имея реальной власти в королевстве и патриархате, постоянно конфликтуя с королём и знатью, Даиберт покинул Иерусалим (сентябрь 1102 г.) и отправился искать поддержки в Рим, где папа Пасхалий II восстановил его в правах (1105 г.). На обратном пути в Святую землю Даиберт скончался в Мессине.