В 1930 г. был закрыт музей-монастырь, с храмов снесены купола. Насельники, в основном, в 1923 г. ушли в другие селения и обители, в том числе в Малоактайский скит верхотурского во имя Николая Чудотворца монастыря, унеся с собой чудотворную икону Успения Пресвятой Богородицы, по преданию, принадлежавшую старцу Далмату. В 1933 г. в Скорбященской церкви разместился колхозно-совхозный театр. В 1941 г. на территории монастыря был образован сборный пункт для новобранцев, в годы Великой Отечественной войны действовали госпиталь, пекарня, Дом культуры, курсы усовершенствования комсостава. В 1945 г. на территории Далматовского монастыря был организован завод молочного машиностроения «Старт», в усыпальнице основателя Далматовского монастыря размещалось гальваническое производство, затем прачечная. При возведении заводских построек были уничтожены многие здания. Активное разрушение комплекса Далматовского монастыря было остановлено благодаря деятельности генерал-майора Дмитрия Андреевича Терехова, добившегося в 1952 г. постановления Совета Министров РСФСР об охране монастырского комплекса. Постановлением Совета Министров РСФСР от 4 декабря 1974 г. комплекс Далматовского монастыря признан памятником истории и культуры республиканского значения, а постановлением от 21 января 1980 г. внесён в перечень памятников культуры, подлежащих первоочередной реставрации. В 1980 г. при Далматовском краеведческом музее был создан Комитет общественного спасения монастыря. 27 сентября 1989 г. при Скорбященской церкви была зарегистрирована приходская община, в том же году началась реставрация храма, он был заново освящён. 6 мая 1992 г. решением Священного Синода Далматовский монастырь был открыт, наместником монастыря утверждён игумен Василий (Ожерельев), с 1998 г. – иеромонах (с 2001 г. – игумен) Варнава (Аверьянов). В 1996 г. в Далматовском монастыре было 12 насельников, в 2006 г. – около 15 насельников. 23 февраля 1993 г. Далматовский монастырь вошёл в состав новообразованной Курганской и Шадринской епархии. Реставрируются сохранившиеся двухэтажная каменная церковь в честь Успения Пресвятой Богородицы (1707–1720 гг.), действующая каменная церковь в честь иконы Божьей Матери «Всех скорбящих Радость» (1871–1881 гг.) с усыпальницей Далмата (1896 г.), надвратная церковь (освящена в 1917 г.), крепостные стены с башнями (XVIII в.), братский и настоятельский корпуса. При участии епископа Курганского и Шадринского Михаила (Расковалова) после завершения раскопок в усыпальнице 6 августа 1994 г. были обретены мощи Далмата, которые почивают в Скорбященской церкви В монастыре есть небольшое подсобное хозяйство, ряд мастерских. Архив Далматовского монастыря XVII – начала XX вв. (более 3 тыс. единиц хранения) находится в Государственном архиве города Шадринска Курганской области.