Исследователям известно три перечня книг, заказанных Досифеем для Соловецкого монастыря. Два перечня помещены в приписках к рукописям из Соловецкого собрания Российской государственной библиотеки, 1493 и 1494 гг.; третий – в составе описи Соловецкого монастыря 1514 г. с заглавием «А се Досефеева данья книг, игумена бывшаго». В перечне 1493 г. названы 17 книг, посланных Досифеем «в дом Спасу на Соловкы», из которых десять сохранились в составе Соловецкого собрания и имеют экслибрис книжника: «Маргарит», 1490/1491 г. (Российская государственная библиотека, наиболее ранняя известная рукопись, переписанная по заказу Досифея); «Ареопагитики» с толкованиями Максима Исповедника, 1492 г.; 16 пророков с толкованиями, 1492 г.; Кормчая, 1493 г.; Апокалипсис с толкованиями епископа Андрея Кесарийского, 1493 г.; Шестоднев Иоанна, экзарха Болгарского, не позднее 1493 г.; Поучения Кирилла Иерусалимского, не позднее 1493 г.; сборник полемических сочинений и Житий, не позднее 1493 г.; Шестоднев Севериана Габальского, не позднее 1493 г.; Торжественник постный, четий, 1493 г. (Российская государственная библиотека). В перечне 1493 г. также упомянуты «Селивестр», «Пчела», «Фёдор Студит», «Иван Дамаскин», «Палея», «Василий Кесарийский», «Анастасий», не отождествлённые с известными рукописями. В перечне 1494 г. названы 24 манускрипта: к перечню 1493 г. добавлены три книги из уже посланных на Соловки и четыре рукописи, заказанные, но ещё не отосланные в монастырь. Почти все они имеют экслибрис Досифея: Минея «новым чудотворцам», 1494 г. (Российская государственная библиотека); Устав, 1494 г.; Житие Иоанна Златоуста, не позднее 1494 г.; Житие Андрея Юродивого с прибавлениями, не позднее 1494 г.; сочинения и Житие Афанасия Александрийского, не позднее 1494 г. (Российская государственная библиотека); Минейный сборник на сентябрь, не позднее 1494 г. (Российская государственная библиотека); Минея-Четья на октябрь, не позднее 1494 г. (Российская национальная библиотека; отождествление предположительное). В перечне 1514 г. помимо 24 книг, названных в перечнях 1493 и 1494 гг., перечислены 19 рукописей (итого 43 книги), но в конце утверждается, что «всех книг Дософеева данья пятдесят без четырех», т.е. 46 рукописей. 8 из 19 книг, поступивших в монастырь от Досифея в 1495–1514 гг., могут быть предположительно отождествлены. Экслибрис Досифея помещён в Торжественнике праздничном, конца XV в. (Российская национальная библиотека), и в Псалтири с толкованиями Афанасия Александрийского, конец XV в. (Российская национальная библиотека). Остальные шесть книг отождествлены следующим образом: Минея служебная за декабрь, пергамен, XV в. (Российская национальная библиотека, отождествление Маргариты Владимировны Кукушкиной); Синаксарь триодный, конец XV в. (отождествление М.В. Кукушкиной); Пятикнижие Моисеево, конец XV в.; «Измарагд», конец XV в.; Скитский патерик, XV в.; Псалтирь, конец XV в. Не отождествлены названные в перечне 1514 г. рукописи: шесть томов Октоихов, два толковых Евангелия, «Ефрем Сирин в десть», «Онтиох Семен Новый» и Патерик египетский.