Насельники Дивногорского монастыря пытались бороться с расколом, распространившимся на Дону после 1682 г. В 1684 г. инок Герман отправился в центр раскола город Черкасск и проповедовал там два года. Одним из уважаемых старцев XVIII в. был уставщик Дивногорского монастыря Доримедонт. Среди почитаемых настоятелей XIX в. был строитель иеромонах Меркурий (Коротков; в схиме Марсалий). В XVII–XX вв. Дивногорский монастырь посетили более тридцати архипастырей, в том числе преемники Воронежского святителя Митрофана – святители Тихон Задонский и Антоний (Смирницкий), священномученик Тихон (Никаноров). В 1696 г. в Дивногорском монастыре перед Азовским походом молился главнокомандующий сухопутными войсками Алексей Семёнович Шеин, 6 мая 1699 г. обитель в первый раз посетил император Пётр I, в 1702 г. – адмирал Фёдор Матвеевич Апраксин, весной 1709 г. – Пётр I вместе с архиепископом Воронежским и Елецким Арсением (Костюриным). Описание монастыря и встречи Петра I с монахами приводится в дневнике («Розыскания о Доне, Азовском море, Воронеже и Азове») вице-адмирала Корнелия Крюйса за 1699 г.: «Монастырь в меловой горе, стоя на своих натуральных столбах, в нём хитростно высеченных, в котором изрядная церковь есть с покоями. Недалеко деревянная каплица, в которой монахи зимою службу Божию отправляют. Сии люди живут зело благоговейно и не едят ничего кроме рыбы. Его Величество изволили со всеми имеющимися господами там кушать, в которое время немалое пушечная пальба с кораблей была. Но каждый раз монахи уклонялись и затыкали руками свои уши». Продолжая описание Дивногорья, Крюйс называет его «парадижем (раем) Российском земли». Пещерные памятники Дивногорского монастыря привлекали к себе внимание не только историков, археологов и краеведов, но и известных писателей. В память посещения Дивногорского монастыря великим князем Сергеем Александровичем в 1897 г. рядом с обителью на берегу Дона учреждена станция Общества спасания на водах. При основании Дивногорского монастыря на берегу реки Дон в 1653 г. была построена деревянная церковь во имя Николая Чудотворца с кельями и оградой. В 1658 г. возвели и в 1659 г. освятили деревянную церковь в честь Успения Пресвятой Богородицы. В августе 1685 г. посланный в район Дивногорья Иван Жолобов «с товарищи» оставил описание Дивногорского монастыря: «Ограда... рублёная брущатая дубовая четвероугольная. На углах четыре башни. В том монастыре соборная церковь во имя Пресвятыя Богородицы Успения, другая церковь с трапезою во имя великого чюдотворца Николая. А церкви построены брущатые, дубовые». К 1750 г. обветшавшая Успенская церковь была разобрана, и в 1751 г. (по другим данным, в 1755 г.) построен каменный Успенский собор с приделом Николая Чудотворца – трёхлепестковый в плане, в скромных формах провинциального барокко. В 1758 г. на месте обветшавшей деревянной Никольской церкви по благословению Воронежского епископа Кирилла (Ляшевецкого) архимандритом Феодосием была освящена новая, тёплая, каменная церковь в честь Владимирской иконы Божьей Матери. В 1780 г. были построены двухярусная каменная надвратная колокольня с западным корпусом монашеских келий и восточный флигель.