В конце 1790 гг. молодой граф Николай Петрович Шереметев стал охладевать к театру и капелле. После ликвидации театральной труппы в 1807 г. сохранил лишь певческую капеллу под управлением С.А. Дегтярёва. В историю русской музыки С.А. Дегтярёв вошёл как талантливый композитор, мастер сочинений для хора «а капелла». Наследие композитора весьма обширно, но точного списка его сочинений нет. Из «Реестра» капеллы Дмитрия Николаевича Шереметьева известно 96 названий сочинений С.А. Дегтярёва: оратория «Минин и Пожарский, или Освобождение Москвы», по одному трёхголосному и двуххорному концерту, 69 четырёхголосных концертов и 23 хоровые пьесы. Оратория «Минин и Пожарский, или Освобождение Москвы» была исполнена под управлением автора в обстановке патриотического подъёма кануна Отечественной войны 1812 г. Звучание симфонического оркестра, эффекты рогового оркестра и пушечной пальбы в апофеозе, в сочетании с умелым развитием музыкальной драматургии произвели огромное впечатление. Оркестр был составлен почти из 200 музыкантов и певцов. Хоровые части из оратории стали хрестоматийными, входили в репертуар любительских, учебных, а также профессиональных хоров. Ещё одна сторона творчества С.А. Дегтярёва – обучение крепостных инструменталистов и певцов. С этой целью он составил «Историческую хрестоматию церковного пения», изданную в Петербурге лишь в 1902 г. С воспитательно-педагогической деятельностью композитора связана и его работа над переводом обширного исследования Винченцо Манфредини «Правила гармонические и мелодические для обучения всей музыке...» (СПБ, 1805 г.), которое стало одним из первых музыкальных методических трудов. Несмотря на то, что С.А. Дегтярёв был одним из виднейших музыкальных деятелей Москвы, он подвергался всем унижениям, какие выпадали на долю крепостного. Лишь в 1808 г. ему разрешили жениться. Его супругой стала 23-летняя Аграфена Григорьевна Кохановская, дочь талантливого крепостного актёра, приписанная к слободе Михайловке Дмитриевского уезда Курской губернии. С началом войны С.А. Дегтярёв с женой и детьми с потоком беженцев отправился в Курск. Вскоре стал регентом у льговского помещика. С освобождением Москвы Дегтярёвы вернулись домой. Живя в нищете, тяжело больной С.А. Дегтярёв приступил к созданию новой оратории – «Торжество России и истребление врагов её, или Бегство Наполеона из России», но завершить своё произведение композитор не смог.