Вследствие указа Синода от 30 июля 1866 г. об открытии при училищах приготовительных классов в Тихвинском училище 10 декабря 1866 г. был открыт приготовительный класс, 35 учениц которого ежегодно поступали в первый класс Екатеринославского епархиального училища. В 1872 г. по благословению епископа Екатеринославского Феодосия (Макаревского) при Днепропетровском монастыре был основан кирпичный завод. К 1903 г. монастырь владел 720 десятинами земли. В 1920 г. в Днепропетровском монастыре епископ Александровский Евлампий (Краснокутский) рукоположил во иерея будущего архимандрита Серафима (Тяпочкина). В 1925 г. Днепропетровский монастырь был закрыт, настоятельница и монахини выгнаны из обители. По воспоминаниям, у игуменьи в келье красноармейцы штыками прокололи иконы Спасителя и Божьей Матери, причём в отверстия на месте уст вставили зажжённые папиросы. В помещениях Днепропетровского монастыря была открыта школа-интернат для детей-инвалидов, сирот и детей репрессированных родителей. В 1941 г. дети из интерната были эвакуированы. Во время оккупации Днепропетровска в 1943 г. по ходатайству насельниц и при участии Днепропетровского епископа Димитрия (Магана) Днепропетровский монастырь был открыт, в обитель вернулись многие сёстры. Настоятельницей стала монахиня Геннадия, с 1946 г. – монахиня Ксения (Романовская), с 1958 г. – монахиня Руфина, в 1959 г. возведённая архиепископом Гурием в сан игуменьи. С 1942 г. богослужения совершались в освящённой в помещении просфорной церкви во имя великомученицы Варвары, затем – в восстановленном Варваринском храме. Был отремонтирован и Тихвинский собор с левым приделом во имя Марии Магдалины. Монахиня Геннадия сохранила на квартире чудотворный Тихвинский образ и передала в обитель. В Днепропетровском монастыре некоторое время служил будущий викарий Московской епархии епископ Можайский Стефан (Никитин). 5 августа 1959 г. Днепропетровский монастырь был закрыт, под предлогом того, что «в период временной немецко-фашистской оккупации г. Днепропетровска монашествующие воспользовались временной оккупацией, захватили часть территории и пять строений, из которых четыре здания общей площадью 741 кв. м. приспособлены под кельи и одно под молитвенный дом, в последнем до Великой Отечественной войны был клуб и учебно-производственные мастерские школы-интерната... Монастырь оказался на территории и в зданиях, принадлежащих детским учреждениям, что является грубейшим нарушением постановления Совета Министров СССР от 29 мая 1946 г.». К 1959 г. в Днепропетровском монастыре проживало 82 сестры, в том числе 62 монахини старше 55 лет.