В наказе митрополита Павла также содержалось благословение основать на реке Селенге или в каком-либо другом удобном месте монастырь во имя Святой Троицы. В Забайкалье члены Даурской духовной миссии прибыли, как полагают исследователи, весной 1681 г. и сразу приступили к устройству Селенгинского во имя Святой Троицы монастыря при построенной в 1675 г. отставными нерчинскими служилыми людьми Никольской церкви в селе Средняя Заимка (современное село Троицкое). 31 янвря 1684 г. в обители был освящён деревянный храм во имя Святой Троицы, 9 мая следующего года – храм во имя Николая Чудотворца. Окончательно монастырь был устроен к 1690 г. В обитель поступили вклады деньгами, утварью, книгами и облачениями от царя Фёдора Алексеевича, царицы Марфы Матвеевны, тобольского воеводы и стольника Фёдора Алексеевича Головина, который побывал здесь в августе 1687 г. В 1689 г. на нужды Даурской духовной миссии было выделено пособие из казны. Живя в Селенгинском монастыре, игумен Феодосий начал устройство ещё одной мужской обители – на Посольском мысу на озере Байкал, где вблизи бывшего острога Усть-Прорва находились могилы русского посла Ерофея Заболоцкого и членов его посольства, убитых 7 октября 1650 г. Игумен Феодосий прислал сюда из Селенгинского монастыря иеромонаха Макария, старца Филарета и иеромонаха Трифиллия. По некоторым данным, свою деятельность на Посольском мысу иноки начали с сооружения (или возобновления) часовни над могилами членов посольства. 2 ноября 1699 г. Сибирский и Тобольский митрополит Игнатий (Римский-Корсаков) разрешил к часовне «святой олтарь прирубить… и церковь освятить во имя Пресвятые Богородицы Честного Ея Знамения». Тогда же вокруг церкви была сооружена деревянная ограда, внутри которой стояли монашеские кельи. В отличие от Селенгинского монастыря, которому были выделены средства из казны, Посольскому монастырю денег «на строение монастырское... не дано, и лес на строение церковное и монастырское возили собою, а питатца тем монахам нечем и литургии служить нечем же» (челобитная Григория Афанасьевича Осколкова 1707 г.). В 1706 г. комиссар русского торгового каравана в Китай Г.А. Осколков обратился к Тобольскому митрополиту Филофею (Лещинскому) с просьбой разрешить ему постройку в Посольском монастыре за свой счёт церковь в честь Преображения Господня. После получения благословенной грамоты Г.А. Осколков, намереваясь возвести первый каменный собор в Забайкалье, заготовил 300 тыс. штук кирпичей, иконостас, книги и колокола. Однако его намерение не осуществилось, поскольку все нанятые каменщики были отправлены на строительство Санкт-Петербурга. Деревянная Преображенская церковь была освящена в Посольском монастыре в 1722 г. На средства Г.А. Осколкова в обители построили настоятельские и братские кельи, службы. Г.А. Осколков дал вкладом в монастырь деревню Дворецкую с пашенными землями и сенокосами, а также богатые рыболовные тони от реки Прорвы до устья реки Селенги.