После восстания 1875 г. монастырь вновь пострадал от турок: небольшое количество ценных предметов удалось перенести в монастырь Савина (два Евангелия, одно из них в серебряном окладе, столик для хлебов 1650 г., несколько книг). В 1886 г. пожар практически полностью уничтожил Дужи, но благодаря помощи властей Боснии и Герцеговины в 200 тыс. форинтов обитель вскоре была восстановлена. В 1903 г. было построено здание для школы. В 1890 г. приход Дужи составляли 24 села с семью церквами, а в 1926 г. владения монастыря делились на два прихода и включали 26 сёл и девять церквей. В годы Первой мировой войны игумен Герасим (Йованович) и иеромонах Леонтий (Попович) были взяты в заложники, иеромонах Гедеон (Биберич) интернирован, а сербские жители из окрестных сёл выселены. В 1924 г. в Дужи проживали три монаха, в том числе два архимандрита. В 1928 г. к ним присоединились эмигрировавшие из России иеромонах Николай (Ружнецов) и священник Пётр (Семеновых), по приглашению которых художник Михаил Михайлович Хрисогонов расписал церковь «в русском стиле» (его фрески, в том числе образы Николая Чудотворца, великомученика Пантелеимона, св. Саввы и евангелистов, в 1990 гг. были записаны), были увеличены размеры врат и окон, и в церкви положен деревянный пол. Перед Второй мировой войной обитель считалась богатой: имела земли, несколько сот ульев, автомобиль. В 1941 г. русские монахи Евгений (Черневский), Михаил (Соколов) приняли мученическую смерть от партизан Тито. Их могилы находятся на кладбище близ монастыря. Иеродиакон Дамиан (Зотович) отказался исполнить приказание коммунистов и убить иеромонаха Николая (Ружнецова) и мусульманина из Требине, за что был убит. Пришедший в обитель после окончания войны сербский иеромонах (имя исследователям неизвестно) также был убит. Монастырь был разграблен и запущен, во дворе и в храме паслись овцы, богатая библиотека была сожжена, монастырский лес вырублен. С 1954 по 1958 гг. в Дужи размещалась часть Югославской Народной Армии. В монастыре к тому времени сохранились лишь три колокола и Октоих. С 1958 г. трудами монахинь Варвары (Божич; настоятельница в 1958–1962 гг.), Анастасии (1962–1968 гг.) и наместницы Феодоры (Делич) велось восстановление обители как женского монастыря. В 1962 г. обновлённый храм и иконостас работы архимандрита Никодима (Бркича) освятил епископ Захумско-Герцеговинский Владислав (Митрович; впоследствии митрополит Дабро-Босанский). В 1990 гг. иконостас был заменён новым, подаренным Грецией. В 1998–2000 гг. Гаврила Маркович заново расписал храм. Во время вооружённого конфликта 1992–1995 гг. в 2 км от Дужи проходила линия сербско-хорватского фронта, снаряды часто падали рядом со стенами обители. Сёстры с октября 1992 г. по март 1993 г. временно проживали в монастыре Добричево. Много сёл монастырского прихода было уничтожено. Дужи знамениты происшедшим здесь чудом исцеления: в 1847 г. парализованного и покрытого язвами Савву Куштрова братия приняла в монастырь. Вскоре ему во сне явился ангел и исцелил его от всех болезней. В память о чуде в ХХ в. была написана фреска «Чудесное исцеление».