Старшие в роде Бахрушиных являлись старостами и председателями церковноприходского попечительства в приходе Святой Троицы в Кожевниках (в 1870–1894 гг. – Пётр, в 1895–1916 гг. – его брат Александр), проявляли неустанную заботу о благолепии и реставрации Троицкого храма, который современники сравнивали по красоте и богатству церковной утвари с храмом Христа Спасителя. Весьма обширной была храмоздательная деятельность Бахрушиных. При каждом благотворительном учреждении, построенном на средства промышленников, была создана православная церковь: в больнице имени Бахрушиных – в честь иконы Пресвятой Богородицы «Всех скорбящих Радость» и часовня во имя великомученика Пантелеимона, при сиротском приюте в Сокольниках – в честь Святой Троицы с приделами во имя Алексия, человека Божия, и мученицы Наталии, при Доме бесплатных квартир на Софийской набережной – во имя Николая Чудотворца, при приюте в третьем Монетчиковском пер. – во имя равноапостольных Константина и Елены. По инициативе Василия Алексеевича Бахрушина в рабочем посёлке близ Рогожской заставы был воздвигнут величественный храм во имя Василия Исповедника в Новой Деревне с приделами во имя апостолов Петра и Павла и мученика Александра. В завещании Василий Алексеевич оставил крупные денежные суммы Троице-Одигитриеву женскому монастырю (где приняла постриг его сестра Евгения, в монашестве Олимпиада, затем Алексия), церковь во имя Василия Исповедника в Новой Деревне, церквам во имя Святой Троицы в Кожевниках и в Зубове, храмам при больнице имени Бахрушиных, сиротском приюте в Сокольниках и Доме бесплатных квартир на Софийской набережной (сын Василия Алексеевича Николай (1872–1917 гг.) состоял старостой Никольской церкви при Доме бесплатных квартир). Причты церквей должны были пользоваться процентами с этих капиталов. Сын Петра Алексеевича Дмитрий (1844–1919 гг.) был среди главных жертвователей на храм Покрова Богородицы в Черкизове, освящённый 6 июля 1903 г., близ станции Тарасовка Ярославской железной дороги, где располагалась его дача. Его брат Константин (1856–1938 гг.) много лет был церковным старостой и главой церковноприходского попечительства храма во имя святителя Николая в Кузнецах. Многое сделали Бахрушины для благоустройства Зарайска. В 1865 г. купили там дом князя Александра Дмитриевича Волконского с прилегающим земельным участком, где к 1869 г. на средства Петра Алексеевича были построены мужская и женская богадельни, сооружена домовая церковь в честь Казанской иконы Божьей Матери. В начале XX в. Бахрушины сделали щедрое пожертвование на восстановление обветшавшего Зарайского кремля и его храмов. Александр Алексеевич представил план перестройки главного собора кремля во имя Иоанна Предтечи, лично наблюдал за восстановлением храма. В 1912 г. выделил 200 тыс. руб. для строительства в Зарайске бесплатной больницы, которая по его желанию была названа во имя Николая Чудотворца.