В особом футляре в часовне хранилась часть деревянной колоды, на которой приплыл праведный Иаков. Во вторник Светлой седмицы в память явления мощей св. Иакова в Боровичском монастыре совершался крестный ход. Из монастыря в городской Троицкий собор совершались крестные ходы в праздники Пятидесятницы, Введения во храм Пресвятой Богородицы, в день Сошествия Святого Духа на апостолов, в день перенесения мощей Иакова Боровичского. В период Первой мировой войны в монастыре был устроен лазарет для раненых. К 1917 г. в Боровичском монастыре жили шестнадцать монахов и десять послушников, монастырь владел 908 десятинами земли. 19 января 1918 г. особая комиссия Боровичского уездного исполкома описала монастырское имущество, верующие во главе с иеромонахом Валентином оказали сопротивление властям, за что подверглись денежным штрафам. В феврале 1918 г. Совет рабочих депутатов постановил закрыть монастыри Боровичского уезда, весной было изъято имущество Боровичского монастыря: документы, продукты, скот. Молодым насельникам предложили покинуть монастырь, престарелых оставили в организованной при монастыре богадельне. К маю 1918 г. в Боровичском монастыре оставались игумен Владимир, два иеромонаха, иеродиакон. В 1920 г. из обители конфисковали серебряную утварь весом более 16 кг. В Свято-Духовом храме некоторое время продолжались богослужения, затем его закрыли. В 1920–1930 гг. были разобраны главы куполов собора и церковь Иакова Боровичского. В 1937 г. закрыли храм в честь иконы «Умиление». Здание использовалось под сапожную мастерскую, во время войны здесь изготовляли бутылки с зажигательной смесью, затем в храме находилась керосиновая лавка, склад горюче-смазочных материалов завода «Мстатор»; в 1995 г. возобновились богослужения. Под храмом находится целебный источник св. Иакова, освящённый в 1997 г. В 1941–1945 гг. на территории Боровичского монастыря располагались госпиталь, затем воинская часть (до 2001 г.). В 1980 гг. Боровичский участок Новгородской реставрационной мастерской осуществил ремонт с частичной реставрацией служебных корпусов и северо-западной угловой башни. К настоящему времени на территории Боровичского монастыря сохранились собор Сошествия Святого Духа (XVII в.), Иверская церковь над св. вратами (1792 г.) и тёплая церковь праведного Иакова с трапезной палатой (1865–1872 гг.), а также настоятельский корпус, братские кельи, хозяйственный комплекс, ограда с несколькими башнями. Ребро Иакова Боровичского после закрытия монастыря верующие сохранили и передали сначала в Успенский храм Боровичей, в 1960 г. – в приходской храм великомученицы Параскевы Пятницы. 14 сентября 2000 г. в Боровичском монастыре, в храме св. Иакова, был совершён первый после возобновления здесь церковной жизни молебен. С 2003 г. Боровичский монастырь является архиерейским подворьем Новгородской епархии, настоятель священник Валерий Дьячков. Богослужения совершаются в восстанавливаемом храме Святого Духа. В нём же находится рака с частицей мощей св. Иакова. В октябре 2002 г. в Боровичах и в Боровичском монастыре состоялись первые Таисиевские чтения, посвящённые игуменье Таисии (Солоповой).