В 1820 г. утверждён приходской штат: первоначально в него входили священник и причётник, позже – также диакон и пономарь. Престол подземного храма был вырезан в меловой породе, имел серебряный ковчежец. В 1818 г. ожидалось посещение пещер императором: для его встречи была вырыта и украшена большая келья. Но побывавший в Павловске Александр I, по официальным данным, пещеру не посетил. После кончины М.К. Шерстюковой её подвиг был продолжен крестьянами И.А. Тищенко, уроженцем Богучарского уезда, А.Н. Васильченко (в монашестве Антоний) из слободы Новоалександровка, Д.И. Ляпиным из Бобровского уезда, А. и П. Мандрусенко из слободы Воронцовки Павловского уезда Воронежской губернии. Продав своё жильё и имущество, а деньги пожертвовав строящейся обители, они вместе с другими отшельниками основали общину при пещерном храме. К 1866 г. в ней было 25–30 человек. В 1851 г. на вершине меловой горы была построена деревянная колокольня, заменённая в 1857 г. каменной, и приобретён 52-пудовый колокол (другой колокол в 104 пуда, изготовленный на Воронежском колокольном заводе Самофаловых, освящён в 1876 г.). Во второй половине XIX в. в пещерном храме был установлен двухъярусный из позолоченного железа иконостас. Иконы, написанные на железе, располагались в галерее вокруг храма. Особо почиталась чудотворная икона Божьей Матери «Мария обрете благодать у Бога», принесённая странницей в 1830 гг. из Киева. В 1874 г. была написана её копия на металле и оставлена в пещере, а чудотворный образ перенесён в построенную над могилами М.К. Шерстюковой и И.А. Тищенко деревянную Вознесенскую церковь (в настоящее время местонахождение икон неизвестно). В 1880 г. в Белогорский монастырь привезли частицы мощей афонских святых, частицы Животворящего Креста и камня от Гроба Господня. Останки первых пещерокопателей первоначально были погребены на вершине горы, над устроенными ими пещерами, затем перенесены в нижний этаж Вознесенского храма. Над каменными надгробиями подвижников неусыпно читалась Псалтирь. В 1865 г. общинники подали прошение в Святейший Синод об официальном открытии монастыря, но получили отказ. Фактически же монастырь существовал с 1866 г., когда был введён общежительный устав. Братия была приписана к Дивногорскому Успения Богородицы монастырю. Первыми заведующими пещерами были иеромонахи Иероним (1866–1872 гг.) и переведённые из Митрофанова воронежского монастыря Авраам (1872–1875 гг.) и Пётр (1875–1906 гг., с 1882 г.– игумен). Указом Святейшего Синода 20 декабря 1882 г. при Белогорских пещерах был учреждён Белогорский Воскресенский нештатный общежительный мужской монастырь, первоначально называемый Александро-Невским, а заведующий пещерами переименован в настоятеля в сане игумена. В 1866–1882 гг. при пещерах были построены Воскресенская трапезная церковь, гостиница для паломников и братские кельи.