В 1884 г. М.П. Беляев положил начало ежегодным Русским квартетным концертам. 23 ноября 1885 г. в зале Дворянского собрания состоялся первый концерт из серии «Русских симфонических концертов», которые также финансировались М.П. Беляевым. Эти оркестровые концерты на пике своей популярности (во второй половине 1880 гг.) проходили шесть–семь раз в сезон; главным дирижёром их до 1900 г. был Н.А. Римский-Корсаков. Характерно, что в тематические программы Русских симфонических концертов включались сочинения не только петербургских (Михаила Ивановича Глинки, Александра Сергеевича Даргомыжского, композиторов «Могучей кучки»), но и московских композиторов (Петра Ильича Чайковского, Сергея Ивановича Танеева, Александра Николаевича Скрябина, Сергея Васильевича Рахманинова). После смерти М.П. Беляева Русские симфонические концерты финансировались из его средств, завещанных «Попечительному совету для поощрения русских композиторов и музыкантов», и продолжались до середины 1918 г. В 1885 г. М.П. Беляев основал в Лейпциге нотоиздательскую фирму, которой было издано за двадцать лет огромное число русских музыкальных сочинений, начиная с романсов и кончая симфониями и операми. В 1902 г. М.П. Беляев пожертвовал в Императорскую публичную библиотеку 582 тома своих изданий. Эта сторона его деятельности потребовала расхода в несколько сот тысяч рублей, о возврате которых М.П. Беляев и не мечтал. За неделю до кончины, когда болезнь сломила его крепкий организм и заставила лечь в постель, обычный пятничный квартет по настоянию М.П. Беляева всё-таки не был отменён. Он завещал на продолжение и расширение начатого им музыкального дела значительные капиталы. Был похоронен в Санкт-Петербурге на Новодевичьем кладбище. В 1936 г. захоронение было перенесено в Некрополь мастеров искусств Александро-Невской лавры. В 1904 г. Н.А. Римский-Корсаков написал оркестровую прелюдию «Над могилой», посвятив её памяти М.П. Беляева, его большого друга и друга всех русских композиторов. Прямого потомства М.П.Беляев не оставил, но вместе со своей супругой Марией Андриановной, которую все домашние называли Мария Андреевна, воспитывал приёмную дочь Валю. Прапраправнучатый племянник М.П.Беляева – Сергей Юрьевич Виноградов из Костромы (прапраправнук Татьяны Петровны Виноградовой, урождённой Беляевой – родной сестры Митрофана Петровича). Праправнук М.П. Беляева – архимандрит Никон (Якимов), настоятель Храма Святой равноапостольной Марии Магдалины в Гааге (Нидерланды).