Как епископство, так и аббатство Боббио было упразднено в 1803 г., в период оккупации Италии французами, в 1817 г. епископство было восстановлено буллой папы Римского Пия VII (1800–1823 гг.) по требованию короля Сардинии Виктора Эммануила I. В настоящее время Боббио входит в состав епископства Пьяченца- Боббио, в аббатстве (с 1923  г. называется Сан-Коломбано) находится музей. В монастыре Боббио находились скрипторий и коллекции древних рукописей, самые ранние из них относятся к поздней Античности и раннему Средневековью. Например, палимпсест из Ватиканской библиотеки, в котором под текстом комментария на псалмы Августина Блаженного Акилле Ратти (будущим папой Пием XI; 1922–1939 гг.) была обнаружена значительная часть трактата Цицерона «О государстве». Некоторые из древнейших рукописей попали в Боббио уже в VII в. либо непосредственно из Ирландии и Британии, либо через монастырь Люксёй, как, например, Антифонарий из монастыря Бангор. Многие манускрипты были привезены в VIII–IX вв. из Франкского королевства и Испании, однако большинство было создано в скриптории монастыря Боббио. Этот скрипторий, расцвет которого приходится на VIII–IX вв., как полагают исследователи, был организован аббатом св. Атталой. По характеру письма рукописи из Боббио различны, имеются кодексы, написанные унциалом, полуунциалом, местным курсивом, а также орнаментальным ирландским письмом. Согласно каталогу монастырской библиотеки, составленному в X в., в Боббио насчитывалось более 700 кодексов, содержащих библейские (например, фрагменты рукописей готского перевода Нового Завета Вульфилы), патристические и литургические (например, так называемые Туринские фрагменты ирландского антифонария; VII в.) тексты, а также произведения античных классиков (около сотни рукописей). Общий упадок монастыря привёл к сокращению монастырской библиотеки (согласно каталогу 1461 г., здесь хранилось всего 243 рукописи). С конца XV в. на библиотеку Боббио обратили внимание гуманисты, которые начали вывозить из Боббио рукописи, в основном, произведения античных авторов. В 1606 г. часть была перевезена кардиналом Федерико Борромео в Милан и вошла в состав библиотеки Амброзиана, в 1618 г. другая часть – папой Римским Павлом V (1605–1621 гг.) в Ватиканскую библиотеку в Рим. Бенедиктинец Жан Мабильон (1632–1707 гг.), посетивший Боббио в 1686 г., увёз с собой в Париж несколько рукописей, в том числе и знаменитый Миссал (впоследствии они попали в Национальную библиотеку Франции в Париже). В 1722 г. в Боббио насчитывалось всего 160 манускриптов. В 1801 г. библиотека Боббио была опечатана, некоторые рукописи перевезены в Турин (в монастырский архив), а часть распродана с аукциона, впоследствии 69 рукописей было выкуплено А. Пейроном. Около трети манускриптов, хранившихся в Турине, погибло в 1904 г. во время пожара.