Путешествуя в 1903–1904 гг. также по Франции и Италии, Богораз издал очерки «В Италии» (1904 г.). Для историка литературы непреходящий и принципиальный интерес сохраняет феномен сочетания в его лице ученого-этнографа и фольклориста и наблюдательного и эмоционального художника. В 1902 г. в Нью-Йорке Богораз написал этнографический роман из древней жизни «Восемь племён». Теме «русские в Америке» посвящены повесть «Авдотья и Ривка» (1902 г.), рассказ «Ёлка в Нью-Йорке» (1903 г.), явно сохраняющие и поныне свою злободневность. Романтик по складу души и мировоззрения, он не мог примириться с практицизмом американской действительности. Русский слесарь в рассказе «Ёлка в Нью-Йорке» говорит так: «Машины здесь есть, а людей нету...» В романе «За океаном» – также мотив духовной нищеты, бездуховности жизни. Позднее в статье «Что такое американская свобода?» Богораз обличал ханжество и лицемерие, особенно характерное для буржуазного общества, утверждал, что истинным властелином жизни в буржуазной Америке является денежный мешок, а под покровом мнимой демократии процветает денежная псевдоаристократия. В разлуке с родиной усилилась его тяга к идеям народничества, укрепилась связь с традициями русской литературы, например, с творчеством А.С. Пушкина, который в своё время с горечью гуманиста писал о трагедии аборигенов Северной Америки и выражал опасение, что «остатки древних обитателей Америки скоро совершенно истребятся». Вернувшись на родину, Богораз активно включился в работу I съезда российских журналистов, побывал в Ясной Поляне у Л.Н. Толстого уже как автор вышедших в 1903 г. очерков «Духоборы в Канаде», посвящённых русским правдоискателям, которые, вдохновившись толстовским учением, переселились в Канаду, чтобы создать там идеальное общество. В 1905 г. Богораз вошёл в центральное бюро Всероссийского крестьянского союза, входил также в Московский центральный забастовочный комитет, а осенью 1905 г. был арестован по делу всероссийского крестьянского союза и посажен в тюрьму (всего же с 1905 по 1917 гг. он привлекался к суду около 20 раз). Годы 1905–1010 были для него особенно плодотворными: 1905 г. – очерковая книга «Новое крестьянство» (запрещена цензурой); в 1906 г. – «Дни свободы» (также запрещена); вышла также книга из жизни петербургских рабочих «На тракту». В это время постоянно углубляется проблематика его творчества, расширяется тематика, совершенствуется мастерство публициста. В 1907 г. вышел сборник «Красное и чёрное» (репортаж, путевой очерк); очерково-публицистическое повествование о деревне «Мужики в Государственной Думе» (лучшие избранники крестьянства оправдали возложенные на них надежды); статья о современной литературе «Речи живые и мёртвые». Результатом большой поездки по России, по Волге и Кавказу стала вышедшая в 1908 г. книга о послереволюционной стране «Передвинутые души». В 1908–1909 гг. были изданы «Очерки полярной охоты» и так называемые «охотничьи рассказы» («На лося», «Царь-медведь») и др. В 1909 г. написан роман о доисторических временах «Жертвы дракона», в 1908–1910 гг. – серия нравоописательных очерков на петербургские темы (из них составилась очерковая книга «Кругом Петербурга»). Богораз продолжает работу и в области поэзии: в 1905 г. выходит третье издание «Стихотворений», а в 1910 г. – четвёртое издание. В 1910–1911 гг. в Петербурге было издано собрание сочинений Богораза в десяти томах (первое собрание очерков и рассказов вышло в 1904 г.). Во время Первой мировой войны он выехал на фронт как начальник санитарного отряда Союза городов, был на Карпатах, в Польше, Венгрии, печатал корреспонденции в газете «Биржевые ведомости». С 1918 г. Богораз возобновляет работу в Музее антропологии и этнографии, работает председателем Петроградского филиала Комитета Севера. В эти годы напряжённой и плодотворной научно-общественной работы он создаёт алфавит и грамматику чукотского языка, преподает в Географическом институте, в институте народов Севера, в Петроградском университете; как свидетельствуют современники, его аудитории всегда переполнены. Через полмесяца после освобождения г. Архангельска от интервентов в 1920 г. была организована Северная научно-промысловая экспедиция при научно-техническом отделе ВСНХ. К руководству Учёным Советом экспедиции были привлечены академики А.П. Карпинский, А.Е. Ферсман, Ю.М. Шокальский, Л.С. Берг, В.Л. Комаров, профессора Н.М. Книпович. В.Г. Тан-Богораз и др. Богораз с 1921 г. преподавал также этнографию, фольклор и языки народов Севера в Географическом институте, затем в Институте народов Севера, Ленинградском государственном университете, на Северном отделении Педагогического института им. Герцена в звании  профессора.