Составленный им объемный «Библиологический словарь» (2002 г. Т. 1–3) представляет собой единственное специальное издание на русском языке, содержащее статьи об основных западных и отечественных библеистах, о методах и принципах библейской критики, об основных школах и направлениях в библеистике. Развитие славистики во второй половине XX в., а также наличие в России богатой коллекции рукописных источников создали относительно благоприятные условия для текстологических исследований славянской Библии. Плодом этих трудов стал выпуск профессором А.А. Алексеевым научных изданий «Текстология славянской Библии» (1999 г.) и «Песнь Песней в древней славяно-русской письменности» (2002 г.), содержащих историю всех славянских переводов Библии и одной из ее книг. В советской и впоследствии в российской академической исторической науке исследование по смежным с библеистикой дисциплинам проводилось в рамках востоковедческой школы такими учеными, как Н.В. Пигулевской, Д.В. Щедровицким, И.Д. Амусиным, А.А. Немировским, И.Ш. Шифманом, И.П. Вейнбергом и др. Исследованию историко-культурной среды существования первохристианской общины и формированию новозаветной литературы посвящены труды И.С. Свенцицкой, Е.Н. Мещерской, А.Ч. Козаржевского, И.А. Левинской и др. Об основных этапах развития современной отечественной библеистики можно судить также по статьям, опубликованным в альманахе «Мир Библии» (1993 г.) и ж. «Страницы» (с 1996 г.). Изучение древних языков и дисциплин, связанных с библеистикой, ведется как в церковных, так и в светских высших учебных заведениях. Результатом работы семинаров по библеистике, организованных при Институте Восточных культур при РГГУ, стало появление сб. статей, посвященных библейской филологии («Библия: Литературные и лингвистические исследования». 1998–2001 гг. 4 вып.). Однако большинство авторов этой научной школы, игнорируя православную традицию, видят развитие отечественной библеистики как науки в парадигме историко-критических методов, выработанных западными школами богословия. Появление работы священника Леонида Грилихеса «Археология текста: сравнительный анализ Евангелий от Матфея и Марка в свете семитской реконструкции» (1999 г.) свидетельствует о начале возрождения православной библеистики. Выводы автора, исследующего становление новозаветной письменности, не противоречат древнейшему церковному Преданию о том, что в основе Евангелия от Матфея лежит текст, первоначально написанный на древнееврейском языке. По инициативе Святейшего Патриарха Московского и всея Руси Алексия II в августе 1999 г. возобновила деятельность Патриаршая и Синодальная Библейская комиссия, ответственным секретарем которой был назначен директор Синодальной библиотеки протоирей Борис Даниленко. Комиссия организовала и провела ряд международных научных конференций, посвященных текстологии славянской Библии.