При Бородинском монастыре действовали гостиница, богадельня, больница, за стенами монастыря с 1901 г. – церковноприходская школа. Монастырь существовал на средства благотворителей, среди которых были российские императоры, представители аристократических семей (графиня Анна Алексеевна Орлова-Чесменская, княгиня Татьяна Васильевна Юсупова, граф Дмитрий Николаевич Шереметев, Александр Михайлович и Татьяна Борисовна Потёмкины и др.), купцы (Иван Васильевич Прохоров и его братья, Николай Васильевич Игумнов и др.). С 30 июля по 2 августа 1847 г. по приглашению игуменьи Марии в Бородинском монастыре находился Игнатий (Брянчанинов), беседовал с сёстрами, в том числе со своей духовной дочерью Антониной Московской (Троилиной), будущей игуменьей монастыря Страстной иконы Божьей Матери. По благословению схимонаха Зосимы (Верховского) в Бородинском монастыре подвизалась схимонахиня Сарра (Потёмкина; ум. в 1911 г.). Другая почитаемая старица Рахиль (Короткова) окормляла до 1928 г. насельниц обители и многих мирян. В 1912 г., в дни празднования 100-летия победы в Отечественной войне 1812 г., Бородинское поле и обитель посетил император Николай II с царственной семьёй. По воспоминаниям монахини Мелании (Барановой), в 1920 гг. в Бородинском монастыре жили около 270 сестёр, во Владимирском соборе ежедневно служили литургию и вечернюю службу, в церкви Филарета Милостивого – полунощницу, в Спасском и Предтеченском храмах богослужения совершались только на престольные праздники. По некоторым сведениям, в Великий пост из Нижнего Новгорода в Бородинский монастырь приезжал исповедовать Георгий (Лавров). 26 февраля 1929 г. монастырь был закрыт, здания переданы коммуне имени Климента Ефремовича Ворошилова. Последняя игуменья Лидия (Сахарова) вместе с сёстрами поселилась в Семёновском, в ноябре 1930 г. была арестована, после окончания шестилетнего заключения уехала на родину, где скончалась. В 1930 гг. помещения обители занимали школа, общежитие, военный госпиталь, турбаза. В годы Великой Отечественной войны немецкие оккупанты устроили в Бородинском монастыре госпиталь. В 1950 гг. на территории обители находились машинно-тракторная станция, затем турбаза. Храмы обветшали, но с 1970 гг. по инициативе Бородинского военно-исторического музея-заповедника в Бородинском монастыре проводились реставрационные работы. 11 августа 1992 г. часть монастырских зданий была передана РПЦ. 16 августа 1992 г. во Владимирском соборе митрополит Крутицкий Ювеналий (Поярков) отслужил литургию, на которой возвёл монахиню Серафиму (Исаеву) в сан игуменьи возобновлённого монастыря, с 1999 г. Бородинским монастырём управляет игуменья Таисия (Исаева). В обители ежегодно 8 сентября после литургии во Владимирском храме совершается крестный ход к главному монументу Бородинского поля, где служатся благодарственный молебен и заупокойная лития. В Бородинском монастыре особо почитается Филарет Московский, частица мощей которого находится в алтаре Владимирского храма, также чтится память игуменьи Марии (Тучковой). К прославлению преподобной Рахили в лике местночтимых святых, совершившемуся 26 июля 1996 г., сёстрами обители были составлены служба с акафистом и жизнеописание святой; над могилой Рахили, за южной стеной монастыря, поставлена деревянная часовня, освящённая 10 октября 1997 г. митрополитом Ювеналием. 6 июля 1999 г. Бородинский монастырь посетил патриарх Алексий II.