При решительной поддержке епархиального собрания, выступившего в защиту митрополита Евлогия, тот принял решение о своём переходе вместе с возглавляемыми им приходами в юрисдикцию Константинопольского патриархата. 17 февраля 1931 г. Константинопольский  патриарх Фотий II (1929–1935 гг.) принял западноевропейские русские церкви и приходы в свою юрисдикцию со статусом экзархата; Александро-Невский храм перешёл в Константинопольский патриархат. В патриаршем томосе говорилось о временном пребывании приходов в составе Константинопольской церкви. С августа 1945 г., когда митрополит Евлогий вместе с подчинявшимися ему клириками и приходами возвратился в лоно Матери-Церкви, Александро-Невский храм оставался духовным центром русских церквей в Западной Европе. После кончины митрополита Евлогия (8 августа 1946 г.) митрополит Ленинградский и Новгородский Григорий (Чуков) вручил викарию почившего святителя архиепископу Ницкому Владимиру (Тихоницкому) постановление Священного Синода о назначении экзархом Московского патриарха в Западной Европе митрополита Серафима (Лукьянова), возглавлявшего до августа 1945 г. западноевропейские приходы Русской православной церкви за границей и воссоединившегося с Матерью-Церковью одновременно с митрополитом Евлогием. В октябре 1946 г. чрезвычайный епархиальный съезд экзархата под руководством архиепископа Владимира не принял митрополита Серафима, поскольку желал сохранить независимость от влияния советской власти, а также ввиду напряжённых отношений в прошлом с возглавлявшимися митрополитом Серафимом общинами РПЦЗ. Епархиальный съезд вынес решение о переходе экзархата в юрисдикцию Константинопольского патриархата и избрал архиепископа Владимира своим правящим архиереем. 2 февраля 1951 г. митрополит Владимир возвёл Александро-Невский храм в ранг кафедрального собора с сохранением прежнего порядка управления на основании Приходского устава. Преемником почившего 18 декабря 1959 г. митрополита Владимира стал его викарий епископ Сиракузский Георгий (Тарасов), избранный чрезвычайным епархиальным съездом 12 июня 1960 г. и утверждённый Константинопольским патриархом Афинагором (1848–1972 гг.) 12 октября 1960 г. правящим епископом в звании экзарха. Архиепископ Георгий принял на себя звание настоятеля собора Александра Невского. В 1960 гг. старанием священника Петра Струве в нижнем храме был устроен франкоязычный Свято-Троицкий приход.