14 июля 1892 г. указом Святейшего Синода Алексий и его община были приняты в Североамериканскую епархию РПЦ. Алексий открыл в своём приходе школу, преобразованную через несколько лет в миссионерскую. К концу XX в. община в Миннеаполисе стала крупнейшим православным приходом США, насчитывавшим около тысячи прихожан. В 1893–1909 гг. Алексий был настоятелем церкви в Уилкс-Барре (штат Пенсильвания), ставшей центром его миссионерской деятельности среди униатов, некоторое время занимал должность пенсильванского благочинного. По благословению правящих архиереев епископа Николая (Зиорова, 1891–1898 гг.), архиепископа Тихона (Белавина, 1898–1907 гг.) и архиепископа Павла (Рождественского, 1907 г.) Алексий неустанно проповедовал, вёл напряжённую миссионерскую работу, главным образом, среди униатов-карпатороссов. К 1898 г. три униатских священника со своими общинами воссоединились с православной церковью, а к 1909 г. – более 17 общин и около 20 тыс. униатов. При деятельном участии Алексия печатались различные церковные издания, в частности, газета «Свiт». В 1905 г. был инициатором создания «Русского православного кафолического общества взаимопомощи». В результате миссионерских трудов Алексия после его кончины, в период между Первой и Второй мировыми войнами, в Америке и на родине святого, в Словакии, в православие перешли сотни тысяч униатов. Тихон (Белавин) высоко ценил личные качества Алексия и был его духовным наставником. В 1907 г. Алексию было предложено стать епископом для русинов – выходцев из Австро-Венгрии, но он отказался, сославшись на преклонный возраст и немощность. В 1909 г., незадолго до кончины, Алексий был возведён в сан протопресвитера. 29 мая 1994 г., в год празднования 200-летия православия в Америке, Алексий был прославлен в лике святых. На прославлении, совершившемся в монастыре Тихона Задонского (Саут-Кейнан, штат Пенсильвания) и возглавленном митрополитом всей Америки и Канады Феодосием (Лазором), присутствовали представители православных поместных церквей, многочисленное духовенство и тысячи паломников. Нетленные мощи святого были положены в раку у иконостаса монастырского храма Тихона Задонского. Были составлены служба, тропарь, кондак и акафист святому. Существует несколько иконописных образов Алексия, наиболее известный находится у раки с мощами.