21 ноября 1881 г. по благословению епископа Нижегородского Макария (Миролюбова) сёстры обители (около 500) приняли иноческий постриг с облачением в камилавку и рясу. Определением Синода от 10 декабря 1897 г. Арзамасская женская община была обращена в первоклассный женский монастырь с наименованием «Новодевичий, Алексия, человека Божия». 5 февраля 1898 г. настоятельница Арзамасского монастыря монахиня Евгения (Страгородская), тётка Патриарха Московского и всея Руси Сергия (Страгородского), была возведена в сан игуменьи. К 1917 г. в Арзамасском монастыре было 838 насельниц: 90 монахинь и 748 послушниц. К началу XX в. в обители было три храма: пятиглавый холодный Вознесенский храм, построенный и освящённый в 1787 г. игуменом Санаксарского монастыря Венедиктом, расширенный в 1821–1822 и в 1841/1842 гг. на средства купца Василия Максимовича Киселёва, – в нём были устроены семь приделов (во имя Киево-Печерских святых, Николая Чудотворца, Димитрия Ростовского, в честь Сошествия Святого Духа на апостолов, Рождества Иоанна Предтечи, Казанской иконы Божьей Матери, Боголюбской иконы Божьей Матери); 3-этажная Успенская церковь с приделом во имя Алексия, человека Божия, построенная на месте Алексеевской церкви в 1798–1805 гг. на средства московских купцов; церковь во имя Иоанна Лествичника в двухэтажном больничном корпусе, построенном в 1825–1827 гг. на средства купчихи Прасковьи Ивановны Мухиной. В монастыре почиталась икона Божьей Матери «Достойно есть» – дар Пантелеимонова русского монастыря на Афоне; пишут, что во время принесения иконы в монастырь в августе 1853 г. совершилось множество исцелений. В братском трапезном корпусе находилась чтимая икона Николая Чудотворца, по молитвам перед которой в XIX в. прекратились засуха и падёж скота. В Вознесенском храме с правой стороны левого клироса в позолоченном ковчеге хранились частица Креста Господня, 35 частиц мощей святых. Здесь же находилась чудотворная икона Божьей Матери «Утоли моя печали», миром от которой исцелилось несколько сестёр, знамение от неё получил и посетивший в 1868 г. общину Антоний (Медведев). Монастырские постройки включали в себя 19 келейных корпусов, две больницы, странноприимный дом, мельницы, четыре каменных ледника, амбар, конюшни, два пчельника в Арзамасской и Чернухинской лесных дачах и др. В Нижнем Новгороде с 1873 г. Арзамасский монастырь имел подворье. В 1920 гг. Арзамасский монастырь был закрыт. К 2001 г. на его территории находилась воинская часть.