Путевые журналы и этнографические заметки миссионеров о церковной жизни на Аляске были опубликованы в «Американском православном вестнике» или хранились в рукописях в различных архивах. Указом Святейшего Синода от 31 октября 1906 г. на основании предварительного соглашения между архиепископом Тихоном, епископом Аляскинским Иннокентием и епископом Якутским Макарием (Павловым) к Алеутскому викариатству была присоединена Чукотская миссия, а также переданы выделявшиеся российским правительством средства. Подобное решение объяснялось тем, что миссионерам на Чукотку легче было добраться морем со стороны Аляски. Чукотская миссия была приписана к Куикпакской (Юконской) миссии Свято-Михайло-Редутского благочиннического округа, куда 1 августа 1908 г. был переведён настоятелем с назначением на должность благочинного игумен Амфилохий (Вакульский), впоследствии епископ Аляскинский. После перевода епископа Иннокентия на Якутскую кафедру (1909 г.) церковная жизнь викариатства проходила в 1909–1916 гг. под архипастырским наблюдением епископа Александра (Немоловского) и в 1916–1920 гг. – епископа Филиппа (Ставицкого). В этот период занимавшее обширную территорию Алеутское викариатство делилось на Ситкинское (пять церквей и приписных к ним четыре молитвенных дома-часовни, два священника), Уналашкинское (девять церквей, 37 молитвенных домов-часовен, пять священников) и Свято-Михайло-Редутское (три церкви, две часовни и два священника) благочиния. Приюты на Южной Аляске были закрыты, действовал лишь приют Куикпакской миссии на севере. В 1923 г. на Аляскинскую кафедру избран, а в 1924 г. хиротонисан архимандрит Амфилохий (Вакульский). К 1929 г., главным образом, благодаря его трудам Алеутское викариатство состояло из 27 приходов в составе пяти благочиний. В помощь больному и престарелому епископу Амфилохию 12 октября 1930 г. в Сан-Франциско был хиротонисан во епископа Ситкинского настоятель Архангело-Михайловского собора в Ситке, бывший военный священник Российской армии архимандрит Антонин (Покровский). По обсуждавшемуся в епархиальном совете митрополии предложению епископа Антонина, разработанному им совместно с протоиереями Григорием Прозоровым и Андреем Кашеваровым, единое Алеутское викариатство предполагалось разделить на Аляскинское, с резиденцией епископа в Уналашке, и Алеутское, с кафедрой в Ситке. Однако этому предложению не суждено было претвориться в жизнь. Епископ Антонин, с титулом епископа Балтиморского, вскоре был переведён на восточное побережье США в помощь митрополиту Платону по управлению многочисленными восточно-американскими приходами. На попечение епископа Амфилохия оставлено было дальнейшее архипастырское окормление Алеутского викариатства. В 1934 г. Алеутское викариатство было преобразовано в самостоятельную Аляскинскую епархию.